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Pourquoi les plantes monocotylédones sont-elles considérées comme plus évoluées que les dicotylédones ?

Pourquoi les plantes monocotylédones sont-elles considérées comme plus évoluées que les dicotylédones ?


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Pourquoi les caractéristiques suivantes sont-elles avantageuses pour une plante ?

  • avoir atactostèle au lieu d'eustèle
  • avoir moins d'étamines
  • perdre la croissance secondaire
  • passer à la pollinisation par anémophilie (même si ce n'est pas toujours le cas)
  • utiliser le cotylédon comme support de stockage au lieu de l'endosperme

Pourquoi y a-t-il tant de similitudes entre les liliopsida et les gymnospermes ?


Pourquoi les plantes monocotylédones sont-elles considérées comme plus évoluées que les dicotylédones ? - La biologie


Champignons bambusicoles : une revue
Plus de 1100 espèces de champignons ont été décrites ou enregistrées dans le monde entier à partir du bambou et comprennent ca. 630 ascomycètes, 150 basidiomycètes et 330 taxons mitosporiques (100 coelomycètes et 230 hyphomycètes). La plupart des taxons ont été enregistrés en Asie, et relativement moins en Inde et en Amérique du Sud. Les genres de bambou Bambusa, Phyllostachys, Sasa et Arundinaria sont de riches sources de champignons produisant respectivement 253, 178, 84 et 82 espèces. La plupart des espèces sont des saprobes trouvées sur les tiges en décomposition, bien que des agents pathogènes et des endophytes aient également été signalés. Les familles d'ascomycètes les plus communes sur le bambou sont les Hypocreaceae, Phyllachoraceae et Xylariaceae, représentées respectivement par les genres communs Nectria, Phyllachora et Hypoxylon. Les genres d'hyphomycètes les plus représentés sur le bambou sont Acrodictys, Coniosporium, Periconia, Podosporium et Sporidesmium. Des suggestions pour de futurs travaux sur les champignons du bambou sont faites.

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Nouveaux et intéressants lichens et champignons lichénicoles au Brésil
Des lichens et des champignons lichénicoles nouveaux et intéressants sont signalés dans deux régions du Brésil, principalement dans la Serra do Caraça (Minas Gerais), mais aussi dans la Serra da Mantiqueira (São Paulo). Ce sont quelques-uns des résultats d'une réunion internationale sur le terrain visant à collecter du matériel topotypique des taxons décrits dans la région par Vainio un siècle plus tôt. Les espèces suivantes sont décrites comme nouvelles : Acarospora oligyrophorica Aptroot, Fellhanera antennophora Aptroot, Graphina coccospora Aptroot, Lepraria multiacida Aptroot, Placidiopsis hypothallina Aptroot, Pyrenula fusoluminata Aptroot, Pyrenula quarzitica Aptroot, Aptroot, Aptroot Sulcopyrenula cruciampata. Les nouvelles combinaisons suivantes sont proposées : Bacidiopsora tenuisecta (Vainio) Aptroot comb. nov., Brigantiaea subobscurata (Vainio) Aptroot comb. nov., Caloplaca subrubelliana (Vainio) Aptroot comb. nov., Campylothelium megalostomum (Vainio) Aptroot comb. nov., Graphina subvestita (Vainio) Aptroot comb. nov., Micarea poliocheila (Vainio) Aptroot comb. nov., Micarea subgranulans (Vainio) Aptroot comb. nov., Micarea subternaria (Vainio) Aptroot comb. nov., Ocellularia piperis (Vainio) Aptroot comb. nov., Ocellularia stylothecium (Vainio) Aptroot comb. nov., Pyrenula crassiuscula (Malme) Aptroot comb. nov., Rinodina atrofuscata (Vainio) Aptroot comb. nov. et Scoliciosporum camptosporum (Vainio) Aptroot comb. nov. Pour de nombreuses autres espèces, les premiers enregistrements de l'hémisphère sud ou d'Amérique (du Sud) sont donnés.

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Modèles de richesse en espèces chez les champignons intestinaux symbiotiques (Trichomycètes)
Le modèle le plus courant en biologie indique que la diversité (nombre d'espèces) augmente avec la surface et peut être représentée sous forme de courbes espèce-surface suivant une équation de modèle de puissance. Les biogéographes et les écologistes ont observé cette relation à la fois entre de plus grandes zones de biotes uniques et entre les îles d'un archipel. Les relations espèces-zones n'ont pas été bien établies pour les communautés fongiques. Les quelques études existantes montrent des résultats hétérogènes. Une tentative de tester la relation espèce-zone chez les Trichomycètes a été faite pour les données collectées entre 1960-2000. Au cours de cette période, 46 espèces de différents comtés américains de l'Arkansas, du Kansas, du Missouri et de l'Oklahoma ont été identifiées. Les nombres d'espèces ont été tracés en fonction de la superficie du comté en tant que placettes d'échantillonnage. Les données correspondent fortement à une courbe de régression de puissance (r2 = 0,92). Cela suggère un signal biogéographique fort pour la relation espèce-aire de ces champignons symbiotiques.

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Champignons aquatiques du lac Fuxian, Yunnan, Chine
Soixante-quatre champignons supérieurs ont été enregistrés sur du bois, du bambou et des racines d'arbres submergés dans le lac Fuxian, Yunnan, Chine. Aniptodera chesapeakensis, Dictyosporium heptasporum et Savoryella lignicola ont été fréquemment récoltés sur des échantillons de bois. L'occurrence de Halosarpheia retorquens et Halosphaeria cucullata, qui ont déjà été signalées dans des habitats marins, est intéressante, tandis qu'une espèce de Lulworthia est le premier signalement de ce genre dans un lac. Pseudohalonectria fuxianii sp. nov. est décrit, illustré et comparé à des espèces similaires du genre. Il s'agit du premier signalement de communautés fongiques aquatiques dans un lac de Chine continentale et les données sont comparées à des études précédentes.

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Réinterprétation de Cocconia palmae, avec description du genre Dianesea (Ascomycota : Dothideomycetidae)
La circonscription originale de Cocconia palmae F. Stevens s'est avérée être constituée d'éléments de deux espèces non apparentées, appartenant à Hysterostomella Speg. (Parmulariaceae) et un genre non décrit de Dothideomycetidae probablement se rapportant aux Coccoideaceae respectivement. Le nom Cocconia palmae est typifié pour représenter ce dernier champignon, pour lequel le nouveau genre Dianesea est introduit.

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Assemblages d'endophytes dans les feuilles jeunes, matures et sénescentes de Rhizophora apiculata :
preuves du rôle des endophytes dans la dégradation de la litière des mangroves
Des feuilles de Rhizophora apiculata de différents niveaux d'âge ont été étudiées pour leurs assemblages d'endophytes. Le nombre d'espèces ainsi que le nombre d'isolats d'endophytes pouvant être récupérés à partir des feuilles augmentaient avec l'âge des feuilles. Le mycobiote endophyte n'est pas resté statique après la chute des feuilles. Les endophytes semblaient croître ou décliner selon l'environnement où les feuilles pouvaient tomber (sol ou eau de mer). Certains endophytes tels que Cladosporium cladosporioides, Phyllosticta sp. et Sporormiella minima a diminué dans les feuilles mortes, quel que soit l'environnement où la feuille pourrait tomber. Quelques champignons qui existaient probablement en tant qu'endophytes à basse fréquence dans les feuilles vivantes sont apparus à des fréquences plus élevées après la chute des feuilles. Une telle activité de croissance de ces endophytes et leur capacité à produire certaines enzymes sont révélatrices de leur rôle potentiel dans la dégradation de la litière.

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Haliphthoros spp. à partir d'œufs pondus de crabe de boue en captivité, Scylla serrata, de géniteurs
La surveillance de la flore fongique des œufs pondus du crabe des marais en captivité, Scylla serrata, a été menée dans plusieurs écloseries du Département d'aquaculture du Centre de développement des pêches de l'Asie du Sud-Est à Iloilo, aux Philippines. La quantification de la mycoflore des œufs a révélé la dominance des oomycètes, en particulier Haliphthoros spp. chez les reproducteurs qui ont avorté leurs œufs avant l'éclosion. Deux espèces de Haliphthoros (H. philippinensis et H. milfordensis) ont été identifiées parmi les 24 isolats collectés. Haliphthoros milfordensis était l'espèce dominante. Des études physiologiques sur la croissance végétative et la sporulation des deux espèces montrent que H. philippinensis a une gamme optimale plus large pour les exigences de salinité et de température que H. milfordensis, en particulier dans la sporulation. L'étude de pathogénicité a montré que seul H. milfordensis était pathogène pour les œufs pondus de S. serrata, alors que H. philippinensis ne l'était pas. L'infection des œufs de S. serrata par H. milfordensis a été observée à partir de deux jours après l'inoculation des zoospores avec un taux d'infection de 2 à 5 %, atteignant jusqu'à 10 % cinq jours après l'inoculation.

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Champignons dominants des récifs coralliens australiens
Ce rapport décrit 617 champignons isolés des récifs coralliens dans les environnements marins australiens tropicaux. Les substrats hôtes comprennent 62 sédiments, des algues (8 Rhodophyta, 9 Chlorophyta, 3 Phaeophyta) et des vertébrés/invertébrés (16 Bryozoa, 21 Chordata, 16 Cnidaria, 70 Porifera). Les résultats indiquent que certains habitants des récifs peuvent constituer un réservoir naturel pour des genres fongiques normalement associés à d'autres organismes. Des taxons tels qu'Aspergillus et Penicillium, que l'on pense généralement provenir du ruissellement terrestre, ont été fréquemment isolés d'hôtes extracôtiers. Cent vingt et un isolats (19,6 % du total) ont sporulé, mais n'ont pas pu être identifiés à l'aide des clés taxonomiques disponibles, tandis que 99 isolats (16 %) n'ont pas sporulé et ont donc été classés comme mycélium stérile. Certains isolats, tels que Cochliobolus spp., n'ont pas été décrits auparavant à partir de sources marines et pourraient représenter de nouveaux taxons. Les ascomycètes marins à croissance lente n'étaient pas isolés, probablement parce qu'ils étaient dépassés par les taxons à croissance plus rapide.

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Production d'enzymes ligninolytiques par Polyporaceae de Lombok, Indonésie
Des polypores ont été isolés dans plusieurs forêts de l'île de Lombok, en Indonésie, et examinés pour leur capacité à dégrader la lignine. Soixante des soixante-cinq échantillons isolés ont été testés à l'aide d'un essai qualitatif sur plaque par visualisation directe de la décoloration sur plaque de gélose contenant le colorant polymère Poly R-478 (0,02 % p/v). Quinze isolats ont pu décolorer le colorant, indiquant une capacité de dégradation de la lignine. Des tests enzymatiques spectrophotométriques de tous les isolats sélectionnés ont été effectués pour examiner la production d'enzymes ligninolytiques (laccase, lignine peroxydase et manganèse peroxydase). Douze isolats sélectionnés ont produit les trois types d'enzymes testés, mais Hexagonia tenuis sp. A, Inonotus patouillardii et Stereum sp. produit uniquement de la laccase et de la lignine peroxydase. L'importance de cette étude pour soutenir la biotechnologie dans l'industrie du papier est discutée.

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Évaluation rapide de la biodiversité d'un assemblage de myxomycètes tropicaux - Réserve de forêt nuageuse de Maquipucuna, Équateur
Au cours d'une période de trois semaines fin novembre et début décembre 1998, l'assemblage de myxomycètes associés aux forêts de nuages ​​dans la réserve forestière de Maquipucuna (ouest des Andes, Équateur) a été étudié au moyen de collectes sur le terrain et d'échantillonnage de substrat pour la préparation ultérieure de cultures en chambre humide. . Sur plus de 1000 enregistrements de myxomycètes (dont environ la moitié provenant de cultures en chambre humide), 77 taxons ont été identifiés avec certitude, 30 d'entre eux sont nouveaux pour le pays. Les descriptions taxonomiques et les observations écologiques des taxons rares et/ou provisoirement nouveaux rencontrés dans l'étude sont fournies dans une liste de contrôle annotée. La distribution de fréquence des 67 taxons identifiés à partir des enregistrements de terrain peut être décrite par un modèle log-normal. Cela permet une estimation du nombre total d'espèces à prévoir, et le nombre réellement enregistré représente environ 92% de ce chiffre estimé. En utilisant une méthode bootstrap avec un modèle de saturation, le même type d'estimation a été déterminé pour une série de substrats utilisés pour la composante chambre humide de l'étude. À une exception près, toutes les estimations obtenues se situaient entre 67 et 92 % du nombre total d'espèces attendues. Les registres de taxons obtenus à partir de cultures en chambre humide et collectés sur le terrain se complètent en termes d'espèces représentées. En tant que tel, on peut supposer que plus de 75 % de toutes les espèces de myxomycètes présentes dans les forêts nuageuses étudiées ont effectivement été enregistrées dans notre étude. Cela démontre la possibilité d'évaluer la biodiversité des myxomycètes dans les forêts tropicales avec un effort d'échantillonnage raisonnable, si les données des études de terrain et des cultures en chambre humide d'échantillons de substrat sont combinées.

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Nouvelles espèces de chacun des genres de pyrénomycètes Hyponectria, Physalospora et Trichosphaeria du Queensland, Australie
Trois nouvelles espèces d'ascomycètes apparaissant chacune sur des feuilles d'Acacia, d'Eucalyptus et de Lomandra respectivement dans le Queensland, en Australie, sont décrites et illustrées sous le nom d'Hyponectria acaciae sp. nov., Physalospora lomandrae sp. nov. et Trichosphaeria eucalypticola sp. nov.

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Planistromella opuntiae sp. nov. du Queensland, en Australie, et clé de l'espèce connue
Une nouvelle espèce d'ascomycète dothideaceous, Planistromella opuntiae est décrite et illustrée du Queensland, Australie. On sait que des espèces de Planistromella sont présentes sur les membres des Agavaceae. Cette nouvelle espèce se trouve sur Opuntia, un membre de la famille des Cactaceae. Il est facilement séparé des autres espèces connues avec des ascospores à 1 septate par ses ascospores relativement plus étroites.

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Conversion induite par la lumière UV de Pestalotiopsis microspora en biotypes avec de multiples formes de conidies
Pestalotiopsis microspora est l'un des endophytes les plus communément isolés associés aux plantes des forêts tropicales et semi-tropicales. La classification taxonomique de ce champignon est principalement basée sur la morphologie des conidies. Les conidies de ce genre possèdent généralement cinq cellules, sont portées dans des acervules et possèdent des appendices. Il a été possible, par irradiation UV, de convertir les conidies de P. microspora (2-3 appendices apicaux et 1 appendice basal par conidie) en biotypes qui ressemblent aux conidies d'autres champignons dont Monochaetia spp., Seridium spp. et Truncatella spp. Les cultures cellulaires uniques de chacun de ces champignons biotypiques biotypiques conservent 100 % d'identité avec les régions 5.8s et ITS de l'ADN avec le champignon source de type sauvage P. microspora, indiquant qu'aucune mutation induite par les UV ne s'est produite dans cette région du génome. De plus, les conidies de ces biotypes générés par les UV restent fidèles à leur forme biologique en produisant également des types de spores dans leurs acervules qui sont identiques aux types de cultures biotypiques dont ils sont issus. Les implications de cette étude sont que de nombreux genres de ce groupe de champignons sont soit étroitement apparentés, soit identiques.


Introduction à la succession fongique
Ce volume de Fungal Diversity est consacré à la succession fongique. Le terme succession fongique est utilisé de manière lâche dans tout le volume. Une définition précise de la succession fongique est « l'occupation séquentielle du même site par des thalles (généralement des mycéliums) », mais le terme peut être utilisé plus librement pour désigner « l'occurrence séquentielle de fructifications fongiques sur des substrats au fur et à mesure de sa décomposition ». Ce volume rassemble diverses études sur la succession fongique, y compris les macrochampignons traditionnellement étudiés et les microchampignons moins bien étudiés. Nous avons ainsi rassemblé une grande partie des données disponibles sur la succession fongique. Le dernier article de ce volume traite des problèmes associés à l'étude de la succession fongique, en particulier chez les microchampignons, et discute des méthodes possibles pour surmonter ces problèmes.

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Succession fongique ou séquence de fructifications
La succession est l'un des concepts écologiques les plus connus. Il est intuitif et pourtant extrêmement complexe. Il y a eu de nombreuses études de succession fongique sur une grande diversité de substrats et pourtant nous en savons encore très peu sur les mécanismes qui conduisent la succession. Les méthodes directes d'observation de la succession fongique (changement d'occupation de l'espace par les thalles) utilisent des techniques destructrices et donc l'évolution des mycéliums en un point de l'espace au cours du temps ne peut pas être observée. Cependant, ces méthodes de destruction directe, avec une réplication appropriée, sont extrêmement utiles pour découvrir des modèles généraux de succession. Les méthodes indirectes n'observent souvent que la séquence du corps du fruit sur un substrat. Ces études peuvent également être extrêmement utiles, mais doivent être interprétées avec prudence. De plus, l'hypothèse sous-jacente selon laquelle la sporulation reflète des changements dans l'occupation mycélienne de l'espace dans le substrat doit être considérée avec soin.

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Succession fongique à différentes échelles
La succession fongique peut être considérée au niveau macro ou micro-échelle. La succession à l'échelle macro peut être reconnue comme l'intégration de différents types de séries de champignons associés à une communauté végétale. D'autre part, la succession à micro-échelle peut être reconnue comme une succession de substrat ou une succession fongique associée à une succession végétale au niveau de la parcelle. La succession des champignons pyrophiles à la suite d'un incendie de forêt est classée comme succession à macro-échelle, mais la succession de champignons pyrophiles à la suite de feux de joie et celle des champignons à l'ammoniac suite à l'ajout d'ammoniac sont classées comme succession à micro-échelle. Le cycle des nutriments dans les zones perturbées par le brûlage local ou l'ajout d'ammoniac est maintenu les activités des microbes existants, y compris les champignons tels que les champignons pyrophiles et les champignons ammoniacaux (Ces champignons sont présents en petit nombre dans les zones non perturbées, mais augmentent rapidement en biomasse suite aux perturbations ). Cet article explore le concept de succession à l'échelle macro et microscopique chez les champignons.

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Saisonnalité et occurrence séquentielle de champignons sur du bois submergé dans le ruisseau forestier de Tai Po Kau, Hong Kong

Les effets de la saisonnalité sur les champignons lignicoles d'eau douce dans le ruisseau forestier de Tai Po Kau ont été étudiés en examinant les communautés fongiques sur le bois submergé d'origine naturelle. La succession fongique (occurrence séquentielle de champignons sporulants) a également été étudiée en étudiant les changements de communautés fongiques sur des appâts en bois de Machilus velutina et Pinus massoniana sur 21 mois. Une plus grande richesse en espèces, moins de champignons dominants et des champignons plus rares ont été trouvés sur le bois submergé d'origine naturelle pendant la saison chaude et humide, par rapport à la saison sèche et fraîche. Les communautés fongiques étaient variables sur les collectes effectuées au cours de différentes saisons chaudes et humides, mais les communautés étaient cohérentes pendant les collectes de saison sèche fraîche. Aniptodera chesapeakensis, Massarina ingoldiana et Sporoschisma nigroseptatum dominaient les communautés fongiques pendant la saison sèche et fraîche, tandis que Nectria cf. byssicola était dominant pendant la saison chaude et humide. Pendant 21 mois d'immersion d'appâts en bois de Machilus velutina et Pinus massoniana, trois types distincts de communautés fongiques ont été observés, à savoir des groupes de succession pionniers, précoces et postérieurs. Une richesse en espèces plus élevée et des champignons plus dominants ont été trouvés sur les deux types de bois au début de la succession. Les différences dans les groupes successifs étaient plus marquées sur les appâts en bois de Pinus massoniana. Les communautés fongiques sur les appâts en bois de Machilus velutina et de Pinus massoniana étaient similaires à la fois au stade pionnier et au début de la succession, mais différaient au stade ultérieur de la succession. Nectria cf. byssicola, Sporoschisma nigroseptatum et S. uniseptatum ont été des colonisateurs précoces sur les deux types de bois. Savoryella lignicola a colonisé plus tard Machilus velutina, tandis que Dictyosporium digitatum, Massarina bipolaris et M. ingoldiana ont colonisé plus tard Pinus massoniana. Un total de 175 champignons, dont 56 ascomycètes, 1 basidiomycète, 115 champignons anamorphiques, 2 myxomycètes et 1 zygomycète, ont été enregistrés dans cette étude.

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Champignons colonisant et sporulant sur du bois submergé dans la rivière Severn, Royaume-Uni

Des blocs tests de Fagus sylvatica et Pinus sylvestris ont été submergés dans la rivière Severn, Angleterre, Royaume-Uni, pendant 92 semaines et récupérés à intervalles fréquents. Les échantillons récupérés ont été incubés dans des chambres humides et des champignons sporulants sur les blocs d'essai ont été enregistrés.Cinquante champignons composés de 35 espèces anamorphiques, 13 Ascomycota et 2 Basidiomycota ont été identifiés. La diversité des espèces (40) était la plus élevée dans les blocs d'essai de hêtre, alors que seulement 28 espèces étaient présentes sur les blocs d'essai de pin sylvestre. Les champignons les plus courants sur le hêtre étaient Camposporium pellucidum, Dictyochaeta parva, Pseudohalonectria lignicola (chacun avec 95 % d'occurrence) et Trichocladium lignicola (89 %). Sur le pin sylvestre, T. lignicola était présent sur 95 % des blocs d'essai. Une succession de champignons sporulants a été observée sur le bois pendant une période d'incubation de 3 mois en laboratoire. Les résultats sont comparés à d'autres études sur les champignons aquatiques lignicoles des régions tempérées et tropicales. Ceux-ci indiquent que différentes communautés fongiques se produisent dans différents emplacements géographiques.

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La communauté macrofongique et le feu dans une forêt de sorbier dans le sud de l'Australie
Les changements dans l'occurrence des macrochampignons avec le temps suivant les activités forestières et les incendies ont été étudiés sur 14 sites dans les forêts dominées par le sorbier (Eucalyptus regnans), dans les hautes terres du centre-est, Victoria, Australie. Des forêts de 0 à 57 ans après le feu ont été utilisées pour comparer les communautés macrofongiques. L'analyse des modèles par la classification et l'ordination a montré qu'il y avait un changement distinct dans la communauté macrofongique au fil du temps depuis la perturbation. Trois phases sont apparues dans le processus de recolonisation après incendie : (1) immédiatement après l'incendie (0 an), (2) une phase intermédiaire (2 et 4 ans) et (3) une phase de maturité ( 7 ans et plus). Les macrochampignons présents dans la forêt de sorbier au cours de la première année suivant l'incendie étaient les plus distinctifs. Le changement dans la suite de macrochampignons reflétait étroitement les changements dans les substrats macrofongiques dans les forêts de différents âges. Les macrochampignons qui se sont révélés spécifiques à certains stades de régénération après un incendie fourniront un sous-ensemble de taxons indicateurs pouvant être utilisés dans d'autres études.

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L'effet de la pré-inoculation du bois de balsa par des champignons marins sélectionnés et leur effet sur la colonisation ultérieure dans la mer
Une étude sur le terrain a été entreprise afin d'examiner l'effet de la pré-incubation de blocs d'essai de balsa avec des champignons marins et leur effet ultérieur sur la colonisation lorsqu'ils sont immergés dans la mer. Quatre ascomycètes marins, Ceriosporopsis halima, Corollospora maritima, Halosphaeriopsis mediosetigera et Marinospora calyptrata, ont été pré-inoculés sur des blocs d'essai en balsa avant la submersion dans la mer. Des blocs témoins et pré-inoculés ont été immergés dans la mer à Langstone Harbour, Portsmouth, Angleterre, et récupérés à 2, 6, 9 et 15 mois et les champignons les colonisant ont été enregistrés. Les champignons pré-inoculés sur les blocs d'essai étaient les seules espèces à sporuler, il n'y avait pas de sporulation de champignons marins indigènes. Les blocs d'essai de contrôle étaient fortement colonisés par de nombreux champignons marins sporulants, et ceux-ci étaient similaires à ceux rapportés dans les études précédentes dans le port de Langstone. Ces résultats sont discutés en relation avec l'inhibition de la sporulation et de la colonisation et la compétition d'interférence.

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Succession fongique sur les feuilles sénescentes de Manglietia garrettii dans le parc national de Doi Suthep-Pui, dans le nord de la Thaïlande
Vingt-deux taxons fongiques ont été identifiés sur des appâts de feuilles sénescentes en décomposition de Manglietia garrettii au cours d'une étude de 56 jours. La plupart des taxons étaient les mêmes que ceux présents sur les feuilles en décomposition naturelle dans la même zone forestière collectée au même moment. Des communautés fongiques distinctes ont été observées en séquence sur les feuilles, les espèces dominantes sur les feuilles étant différentes à chaque stade de succession. Il n'y avait aucun effet notable sur les communautés fongiques, que la surface supérieure ou inférieure des feuilles soit en contact avec le sol forestier. La plus grande diversité fongique s'est produite entre le jour 4 et le jour 40 (stade de communauté mature), la plupart des espèces étant présentes au jour 40. Le jour 56, les feuilles se sont avérées squelettisées, de sorte que les communautés fongiques avaient diminué en nombre.

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La succession coprophile
Cet article passe en revue le contexte des études de la succession coprophile, présente quelques données d'observations faites sur des échantillons collectés pour une étude de l'occurrence et de la diversité des champignons coprophiles, et suggère où d'autres études pourraient aider à élucider les aspects fonctionnels de la succession.

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Colonisation fongique du bois dans un ruisseau d'eau douce à Tad Ta Phu, parc national de Khao Yai, Thaïlande
Une étude de la colonisation fongique de deux bois (Dipterocarpus alatus et Xylia dolabriformis) a été initiée dans un ruisseau d'eau douce à Tad Ta Phu dans le parc national de Khao Yai, en Thaïlande. Le bois a été exposé et récupéré tous les mois pendant 12 mois, puis incubé dans des chambres humides et la colonisation fongique a été enregistrée. Les données sur la séquence de sporulation fongique, la fréquence d'apparition des champignons et le pourcentage de couverture sur les blocs d'essai sont présentées. Soixante-treize espèces ont été recensées : 48 sur D. alatus et 47 sur X. dolabriformis. Les champignons ont été classés en 3 groupes : Groupe 1 ceux présents sur plus de 60 % des blocs tests : avec Helicomyces roseus et Halosarpheia aquadulcis sur D. alatus et Helicomyces roseus sur X. dolabriformis. Les champignons du groupe 2 étaient ceux présents sur plus de 20 % des blocs d'essai et au nombre de 8 chacun sur D. alatus et X. dolabriformis. Les champignons du groupe 3 constituaient ceux présents sur moins de 20 % des blocs d'essai. Les champignons pourraient également être regroupés dans ceux qui sont apparus tôt sur le bois : Bombardia sp., Cancellidium applanatum, Dictyochaeta sp. 1, H. roseus, Pycnidial sp. 1, Sporidesmiella hyalosperma var. novae-zelandiae, Sporoschisma saccardoi et des hyphomycètes non identifiés sp. 05 sur D. alatus et avec Chaetopsina fluva, Dictyochaeta sp. 1, H. roseus, Cosmospora chaetopsinae, Stilbella holubovae et Trematosphaeria sp. 2 sur X. dolabriformis. Les colonisateurs intermédiaires comprenaient : Aquasphaeria dimorphospora, Eluviespora bipolaris, Hymenoscyphus varicosporoides, Sirosphaera sp. 1, Tricladium anamorphe de Hymenoscyphus varicosporoides sur D. alatus, et Biflagellospora gracilis, B. japonica, B. papillata, B. siamensis, Cancellidium applanatum, Halosarpheia aquadulcis et Thozetella nivea sur X. dolabriformis. Les colonisateurs tardifs étaient Massarina sp. 3 et Vargamyces aquaticus sur D. alatus et Helicosporium vegetum, Savoryella verrucosa et Tricladium anamorph de Hymenoscyphus varicosporoides sur X. dolabriformis. Les données montrent une nette différence dans les essences dominantes sur chaque bois et sont comparées à d'autres études des régions tropicales et tempérées.

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Diversité et succession fongique sur des cabosses de Delonix regia (Leguminosae) exposées dans une forêt tropicale en Thaïlande
La succession des champignons sur les gousses de Delonix regia a été étudiée au parc national de Khao Yai, en Thaïlande. Les champignons colonisant les gousses de Delonix regia étaient dominés par des champignons anamorphiques. La succession des champignons commence par la colonisation par des champignons à graines classiques, par ex. Espergillus, Chaetomium, Penicillium et Rhizopus, lorsque les gousses étaient sèches et attachées à l'arbre. Dès que les gousses tombent sur la forêt, les champignons de graines classiques sont rapidement remplacés par des champignons de litière, par ex. Espèces Dictyochaeta, Helicosporium, Phaeoisaria, Phoma et Sporoschisma. La teneur en eau des cabosses peut être un facteur important dans la détermination du mycota qu'elles supportent.

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Analyses expérimentales des occurrences successives de champignons ammoniacaux sur le terrain
L'apparition séquentielle des champignons de l'ammoniac après traitement à l'urée (800 g/m2) a été observée sur le terrain et après incubation à 20 C des sols des horizons L-A1 collectés à différents jours après le traitement. Les résultats indiquent que l'apparition successive de champignons saprobiques ammoniacaux dans le champ résulte de la combinaison de la propagation séquentielle (colonisation) des champignons ammoniacaux et du temps nécessaire à chaque champignon pour produire des structures de reproduction. La propagation séquentielle et le temps de fructification de chaque champignon ammoniacal peuvent s'expliquer par leur degré de tolérance à des concentrations élevées de NH4-N dans des conditions alcalines à neutres. La durée d'apparition des champignons saprobiques de l'ammoniac dans le champ a été raccourcie par les interactions entre les organismes et les changements dans les conditions du sol, en particulier le pH et la concentration de NH4-N, résultant des activités des organismes du sol, y compris les champignons de l'ammoniac. Deux cents carottes de sol (5 & x 5 & x 5 cm) prélevées sur une parcelle (50 & x 100 cm) ont été placées séparément dans des flacons stérilisés. Vingt-deux mg d'urée/g de sol sec ont été ajoutés à chaque flacon et la teneur en eau a été ajustée à 60 %. Après incubation à 20 C, les fréquences de migration (spores et mycéliums, etc.) tracées pour Amblyosporium botrytis, Ascobolus denudatus, Tephrocybe tesquorum et Coprinopsis phlyctidospora ont été estimées à 4/200, 38/200, 52/200 et 9/200, respectivement . Ces quatre champignons ammoniacaux n'ont montré aucune coexistence spécifique entre eux.

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Une nouvelle approche pour étudier la succession microfongique sur les aiguilles de pin en décomposition dans une région subtropicale océanique au Japon
La séquence de succession fongique sur les aiguilles de pin en décomposition a été évaluée à l'aide d'une nouvelle approche. Vingt-deux ensembles de données de communautés microfongiques ont été obtenus à partir d'enquêtes individuelles dans une région subtropicale océanique et ont été réarrangés et modifiés. Les valeurs de constance et d'abondance des espèces individuelles ont été calculées en sélectionnant l'espèce dominante parmi les 122 espèces recensées. Trois stades de succession ont été reconnus et les espèces caractéristiques à chaque stade sont considérées. Les résultats de cette nouvelle approche sont comparés à la méthode orthodoxe basée sur la détermination de la distribution verticale des communautés microfongiques sur un seul site.

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Succession fongique sur les frondes de Phoenix hanceana à Hong Kong
Soixante-treize taxons fongiques ont été identifiés au cours du processus de décomposition des frondes appâts de Phoenix hanceana, comprenant des feuilles, des pointes de rachis, des mi-rachides et des bases de rachis. Des communautés pionnières, matures et appauvries ont été observées en séquence sur les frondes-appâts. Les communautés fongiques sur différentes parties des frondes ont atteint des communautés pionnières, matures et appauvries à des rythmes différents. Les communautés fongiques sur les feuilles et les pointes du rachis ont mûri plus lentement que les autres parties, mais se sont appauvries rapidement par la suite, et les échantillons se sont complètement décomposés au mois 13. Au contraire, les communautés fongiques sur le milieu du rachis et les bases du rachis ont mûri plus tôt au mois 1, mais s'appauvrit au 13e mois. Des frondes naturelles ont également été examinées en même temps. Seulement la moitié des champignons étaient communs aux appâts et aux frondes naturelles. Ainsi, l'examen des frondes appâts à différents stades de décomposition et des frondes naturelles est recommandé pour obtenir une meilleure estimation de la biodiversité.

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Succession fongique sur bambou à Hong Kong
La succession fongique sur Bambusa tuldoides a été étudiée à Hong Kong. Les communautés fongiques ont changé au fil du temps au cours du processus de décomposition. Sur la base de la sporulation des champignons, les communautés fongiques sur les appâts en bambou peuvent être classées en colonisateurs précoces, colonisateurs intermédiaires, colonisateurs ultérieurs, habitants réguliers et habitants sporadiques. Les communautés fongiques sur le bambou et les appâts morts naturellement comprenaient des espèces rares et principalement des colonisateurs à un stade intermédiaire. La saisonnalité a eu un effet, car plus de champignons étaient présents pendant la saison des pluies. Les précipitations ont eu un impact positif sur l'occurrence des champignons, mais la température et l'humidité relative semblaient avoir peu d'influence. Les espèces d'Anthostomella sont des habitants réguliers du bambou, étant dominantes tout au long de la période d'observation et jouant probablement un rôle dominant dans sa décomposition.

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Séquence d'infection et pathogénicité d'Ophiostoma ips, Leptographium serpens et L. lundbergii pour les pins en Afrique du Sud
Trois scolytes exotiques (Coleoptera : Scolytidae), Hylastes angustatus, Hylurgus ligniperda et Orthotomicus erosus, infestent Pinus spp. en Afrique du sud. Ces coléoptères sont généralement considérés comme des ravageurs secondaires, mais peuvent également être vecteurs de champignons ophiostomatoïdes. En Afrique du Sud, au moins 12 champignons ophiostomatoïdes sont associés aux trois espèces de coléoptères, parmi lesquels Ophiostoma ips, Leptographium serpens et L. lundbergii, sont les plus fréquents. Le but de cette étude était de tester la pathogénicité des trois champignons pour les pins en Afrique du Sud. Deux isolats de chaque champignon ont été inoculés sur diverses espèces de pins dans différentes régions d'Afrique du Sud. Les champignons inoculés ont provoqué une exsudation de résine et une décoloration de l'aubier autour des points d'inoculation. Il y avait des différences significatives dans la longueur des lésions entre les espèces inoculées, les moments d'inoculation et les zones de plantation. Bien qu'Ophiostoma ips ait donné lieu à des lésions plus longues que L. serpens et L. lundbergii, nos résultats suggèrent qu'aucune de ces espèces ne doit être considérée comme un pathogène grave.

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Succession : où allons-nous à partir d'ici ?
Divers aspects de la succession fongique et des interactions entre champignons sont passés en revue et les problèmes rencontrés mis en évidence. Des suggestions pour de futures recherches sont présentées, décrivant certaines des techniques actuellement disponibles. Une attention particulière est portée sur la nécessité de comprendre les interactions chimiques impliquées dans la succession.


Production d'enzymes extracellulaires par les ascomycètes d'eau douce
Trente espèces d'ascomycètes d'eau douce isolées de substrats ligneux et/ou herbacés ont été criblées pour leur capacité à produire des enzymes de dégradation extracellulaires sur des milieux solides. Les enzymes testées comprenaient : amylase, endoglucanase, endoxylanase, ß-glucosidase, laccase, lipase, pectinase, peroxydase, polygalacturonase, polyphénoloxydase, protéase, tyrosinase et ß-xylosidase. Toutes les espèces étaient positives pour la cellulase et l'endoxylanase/ß-xylosidase. Deux espèces, Chaetomastia typhicola (herbicole) et Massarina sp. A25 (lignicole) s'est révélé positif pour tous les tests enzymatiques. Submersisphaeria aquatica (lignicole) était positif pour toutes les enzymes sauf la tyrosinase et Jahnula sp. A322 (lignicole) était positif pour toutes les enzymes, à l'exception de la polyphénoloxydase. Généralement, les espèces qui ont été isolées des substrats herbacés et des substrats ligneux/herbacés avaient de bons taux de croissance sur différents types de milieux enzymatiques utilisés (tels que peptone, extrait de levure, gélose au glucose, etc.). Cinquante pour cent des espèces lignicoles produisaient des enzymes dégradant la pectine, contre environ 80 % pour les espèces herbacées et ligneuses/herbicoles, ce qui suggère qu'il peut y avoir une certaine spécialisation dans les types d'enzymes produites au sein des groupes de substrats. Les plus grandes différences entre les espèces se sont produites dans la production d'enzymes associées à la détection de la dégradation de la lignine. La détection de la laccase et de la peroxydase dépendait de la technique de dosage utilisée. Les ascomycètes d'eau douce, en tant que groupe, produisent de nombreuses enzymes extracellulaires importantes dans la décomposition des matériaux structuraux des plantes, soutenant ainsi l'idée qu'ils jouent un rôle important dans le recyclage dans les habitats aquatiques.

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Liste de contrôle annotée des lichens et champignons lichénicoles du Bhoutan
Une liste de contrôle annotée est présentée des 287 lichens et champignons lichénicoles connus du Bhoutan. La grande majorité (225) sont de nouveaux enregistrements pour le pays, basés sur des collections récentes de 264 espèces par le deuxième auteur. La plupart des espèces étaient auparavant connues dans l'Himalaya, mais certaines représentent des extensions considérables de l'aire de répartition. Des exemples notables sont le rare Ropalospora chlorantha, connu jusqu'à présent uniquement dans l'est de l'Amérique du Nord, et le premier signalement de Lepraria nigrocincta dans l'hémisphère nord. Pyrrhospora bhutanensis est décrit comme nouveau pour la science.

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Mycoparasites sur la rouille du caféier au Mexique
Nous avons étudié les plantations de café à la recherche de mycoparasites de la rouille du caféier (Hemileia vastatrix) dans le centre de Veracruz, México. Nous rapportons la présence en conditions naturelles de six mycoparasites. Cinq sont signalés pour la première fois (Acremonium byssoides, Calcarisporium arbuscula, C. ovalisporum, Sporothrix guttuliformis, Fusarium pallidoroserum) comme mycoparasites de H. vastatrix, l'autre espèce, Verticillium lecanii, avait déjà été signalée.

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Notes taxonomiques sur le genre Endoxylina (Diatrypales, Ascomycotina) et description d'une nouvelle espèce du Mexique
Endoxylina tehuacanensis est proposé comme nouvelle espèce dans les Diatrypales (Ascomycotina). Les spécimens ont été collectés sur des branches tombées d'Acacia constricta (Leguminosae) dans la partie sud-est de l'État de Puebla, dans la vallée de Tehuacan, au Mexique. Une description et des illustrations des caractères morphologiques de cette nouvelle espèce sont fournies. De plus, une brève revue de toutes les espèces appartenant à Endoxylina est présentée.

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Une comptabilité des membres mondiaux de la secte Mycena. Longisetae
Onze espèces sont acceptées dans une secte Mycena redéfinie. Longisetae. Deux espèces, M. palmicola et M. khonkhem, sont décrites comme nouvelles, et M. clavulifera est redécrite sur la base de matériel collecté récemment en Thaïlande. Mycena trichocephala, précédemment accepté dans la sect. Sacchariferae est ici accepté dans la sect. Longisetae. Deux Stirps sont provisoirement acceptés pour accueillir les 11 espèces : Stirps Brunneisetosa (4 espèces) et Stirps Longiseta (7 espèces). Tous les membres de la secte. Les longisetae développent des ébauches couvertes de nombreux pileosées dressés et raides qui aident à dissuader la prédation animale sur l'hyménophore immature. Toutes les espèces incluses développent des pileipelli avec des cellules acanthocystes et des stipitipelli avec des hyphes corticaux non spinuleux. Le centre de la diversité pour la secte Mycena. Longisetae est l'Asie du Sud-Est.

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Intralichen, un nouveau genre pour les espèces lichénicoles 'Bispora' et 'Trimmatostroma'
Intralichen gén. nov. est introduit pour quatre hyphomycètes dématiés avec des mycéliums poussant à l'intérieur de l'hyménie et des tissus thallins de lichens ou de champignons lichénicoles et sporulant à la surface : I. baccisporus sp. nov., I. christiansenii peigne. nov. (syn. Bispora christiansenii), I. lichenicola comb. nov. (syn. Trimmatostroma lichenicola), et I. lichenum comb. nov. (syn. B. lichenum). Une clé de l'espèce est fournie et tous les hôtes connus et les rapports de l'espèce sont résumés. dégradation de la litière.

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Nouveaux champignons anamorphes à conidies rhombiques de la litière de la forêt tropicale mexicaine
Deux champignons anamorphes, collectés sur la litière de feuilles du Mexique sont proposés comme nouveaux taxons. L'un d'eux, Beltraniella fertilis, se caractérise par des conidiophores ramifiés aux apex fertiles. L'autre espèce, Pseudobeltrania macrospora, se caractérise par des conidies beaucoup plus longues que toutes les espèces connues de Pseudobeltrania. Des descriptions et illustrations in situ sont fournies, ainsi que les caractéristiques de la culture. Une clé des espèces du genre Pseudobeltrania est incluse.

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Répartition verticale des champignons saprobiques sur les chaumes de bambou
Les champignons sur les tiges de bambou en décomposition ont été étudiés le long d'un gradient vertical sur des sites à Hong Kong et aux Philippines. Champignons saprobiques sur chaumes sur pied de Bambusa spp. et Dendrocalamus spp. étaient stratifiées verticalement dans les deux pays, avec une biodiversité plus élevée vers les bases des chaumes.

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Goidanichiella fusiforma sp. nov. à partir de feuilles de palmier au Brunei et en Thaïlande
Goidanichiella fusiforma sp. nov. a été identifié à partir de collections de feuilles de palmier en décomposition dans les forêts tropicales humides de Brunei et de Thaïlande.Le nouveau taxon est décrit et illustré, et comparé à des taxons similaires.

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Trois taxons de Phallaceae dans HMAS, Chine
Trois taxons de Phallaceae présents en Chine ont été signalés, dont une nouvelle variété Phallus costatus var. sphaerocephalus, une espèce récemment reconfirmée Phallus sulphureus et un nouveau signalement de China Mutinus fleischeri. Tous les spécimens examinés ont été déposés à Herbarium Mycologicum Instituti Microbiologici, Academiae Sinicae (HMAS), Pékin.

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Deux nouvelles espèces hyalines de Chalara, et une clé pour les espèces décrites depuis 1975ud Forest Reserve, Equateur
Chalara siamense sp. nov. est décrite à partir de pétioles morts d'Eleiodoxa conferta (Arecaceae) collectés en Thaïlande, tandis qu'une seconde espèce hyaline, C. schoenoplecti sp. nov., est décrite à partir de tiges sénescentes de Schoenoplectus litoralis (Cyperaceae) récoltées à Hong Kong. Ils sont comparés à des espèces similaires. Trois espèces décrites de manière informelle par T. Matsushima reçoivent des binômes latins et des spécimens types indiqués, et une clé des espèces décrites depuis 1975 est fournie.

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Un nouveau champignon du charbon, Sporisorium centrale sp. nov., sur Themeda d'Australie
Sporisorium centrale sp. nov. (Ustilaginaceae, Ustilaginomycetes) est décrite et illustrée à partir de Themeda triandra collecté dans le Territoire du Nord, Australie. Il est comparé à Sporisorium punctatum.

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Brobdingnagia eucalypticola sp. nov. et Phyllachora neolitseae sp. nov., deux nouveaux ascomycètes phyllachoracés d'Australie
Brobdingnagia eucalypticola sp. nov. et Phyllachora neolitseae sp. nov., causant des taches de goudron sur les feuilles d'Eucalyptus sp. et Neolitsea dealbata sont respectivement décrits et illustrés. s groupe de champignons sont soit étroitement apparentés, soit identiques.

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Nouvelles espèces de Loculoascomycètes foliicoles sur Dysoxylum, Melaleuca et Syzygium du Queensland, Australie
Quatre nouvelles espèces de Loculoascomycètes foliicoles, Didymella melaleucae sp. nov., Rosenscheldiella dysoxyli sp. nov., Seynesiella melaleucae sp. nov. et S. syzygii sp. nov. sont décrits et illustrés du Queensland, Australie. Les hôtes sont indiqués par l'épithète spécifique. Quatre espèces de Discostromopsis sont redisposées à Discostroma sous le nom de Discostroma callistemonis (H.J. Swart) Sivan. peigne. nov., D. elegans (H.J. Swart) Sivan. peigne. nov., D. leptospermi (H.J. Swart) Sivan. peigne. nov. et D. stoneae (H.J. Swart) Sivan. peigne. nov.

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Nouvelles espèces de Lembosia et Lembosina d'Australie
Lembosia araucariae sp. nov., Lembosia syzygii sp. nov., Lembosina alyxiae sp. nov., Lembosina diospyrosi sp. nov. et Lembosina eucalypti sp. nov. sur des feuilles d'Araucaria, Syzygium, Alyxia, Diospyros et Eucalyptus respectivement sont décrites et illustrées d'Australie. Lembosia hosagoudari nom. nov. est proposé pour accueillir Lembosia syzygiicola Hosag. qui est un homonyme ultérieur de Lembosia syzygiicola (Hansf.) Deighton.

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Endophytes fongiques associés à Cordemoya integrifolia
Des endophytes fongiques associés aux feuilles de la plante endémique Cordemoya integrifolia ont été étudiés. La diversité et la fréquence des champignons endophytes dans les jeunes et les vieilles feuilles de Cordemoya integrifiola présents à l'intérieur et à l'extérieur de la zone de gestion de la conservation (CMA) de Maccabhé ont été étudiées. Les assemblages d'endophytes examinés étaient très divers, consistant en 26 taxons fongiques fertiles et une morpho-espèce stérile. Pestalotiopsis sp. et Penicillium sp. étaient les taxons dominants. Des différences ont été observées entre les communautés endophytes isolées de différents tissus et des tissus d'âges différents. Les vieilles feuilles supportaient plus d'endophytes que les feuilles relativement plus jeunes. De même, plus de champignons endophytes ont été enregistrés dans les veines et les pétioles que dans les tissus entre les nervures.

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Microchampignons sur les Pandanaceae : deux nouvelles espèces de Camposporium et clé du genre
Au cours d'une enquête sur les microchampignons qui habitent les Pandanaceae, deux nouvelles espèces de Camposporium ont été trouvées. Camposporium fusisporum sp. nov. et C. ramosum sp. nov. sont décrits, illustrés et comparés aux espèces acceptées. Camposporium cambrense, C. japonicum et C. ontariense sont également signalés parmi les Pandanaceae. Une clé des espèces de Camposporium et un tableau synoptique comparatif sont fournis.


Phyllachora xanthii : redescription et désignation d'un nouveau type
Un champignon de tache de goudron trouvé dans l'état de Paraná, au Brésil sur des feuilles vivantes de Xanthium strumarium a été identifié comme appartenant probablement à l'espèce connue auparavant Phyllachora xanthii. Les descriptions disponibles de ce champignon sont incomplètes et le matériel type n'a pas pu être localisé. Une description complète avec illustrations et désignation d'un néotype est donc fournie.

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Nouvelles espèces épineuses de Mycena dans les sections Basipedes et Polyadelphia de Thaïlande
Trois nouvelles espèces de Mycena à poils épineux sont décrites à partir de matériel collecté récemment en Thaïlande. Mycena pseudoseta et Mycena mimicoseta sont provisoirement acceptés dans la sect. Basipèdes, et ont des épines du chapeau recourbées formées d'hyphes agglutinés, cylindriques et spinuleux. Mycena dermatogloea est provisoirement accepté dans la sect. Polyadelphia et a des épines pileus formées de gloeocystides exsudatives. Des illustrations et des comparaisons avec des taxons alliés sont fournies.

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Communautés fongiques Treehole : hyphomycètes aquatiques, aéro-aquatiques et dématiés
Les communautés d'hyphomycètes dans les trous d'arbres remplis d'eau, un microhabitat dans les écosystèmes forestiers, sont discutées. Treize trous d'arbres dans quatre régions montagneuses et boisées de Hongrie ont été examinés à la recherche d'hyphomycètes. Onze trous d'arbres ont été détectés dans le hêtre (Fagus sylvatica) et un dans le chêne (Quercus sp.) et le frêne (Fraxinus excelsior). Quarante-cinq espèces d'hyphomycètes ont été détectées dans les trous des arbres. Le nombre d'espèces par trou d'arbre variait de 3 à 10, comme observé après incubation de la litière, mais atteignait 19 lorsque la filtration sur membrane de l'eau du trou d'arbre était incluse. L'espèce la plus fréquente était Alatospora acuminata (plus de 80 % des trous d'arbre). La répartition de Colispora cavincola semble se limiter aux trous d'arbres. Les conidies appartenant à des taxons moins connus, tels que Arborispora, Dwayaangam, Trifurcospora et Trinacrium sont discutées et illustrées. La filtration membranaire de l'eau des trous d'arbre suggère une sporulation in situ de certaines espèces aquatiques d'hyphomycètes. Les trous d'arbres dans le sud-ouest de la Hongrie ont été réexaminés après 25 ans et les résultats suggèrent qu'ils sont des microhabitats fongiques de longue durée plutôt qu'éphémères dans les écosystèmes forestiers.

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Effet des ressources en azote et du pH sur la croissance et la formation de fructifications de Coprinopsis phlyctidospora
Après 3 semaines de culture de Coprinopsis phlyctidospora, le pH final des milieux NO3-N, asparagine-N (Asp-N) et Urée-N a augmenté, le pH final des milieux NH4-N a diminué et des concentrations élevées d'azote ont induit un pH final élevé. . Les changements du potentiel d'oxydation de réduction étaient opposés à ceux du pH. La plus grande partie de la biomasse mycélienne a été générée dans les milieux Asp-N, tandis que la moindre biomasse a été générée dans les milieux NH4-N. Des niveaux élevés d'azote ont favorisé une croissance accrue. Pendant la croissance, le NO3-N a été produit par l'utilisation d'Asp-N, d'Urée-N et de NH4-N. Le rendement maximal en NO3-N a été trouvé dans les milieux NH4-N. Sous la lumière, des fructifications se sont formées dans les milieux Urée-N, Asp-N et NO3-N. Dans l'obscurité, des fructifications se sont formées dans le milieu Urée-N uniquement. L'ajout d'urée et de NH4Cl au milieu de croissance non supplémenté a favorisé la formation de fructifications.

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Induction de la production d'antibiotiques de champignons d'eau douce à l'aide de la fermentation en culture mixte
Les activités antibiotiques de filtrats de culture de vingt champignons filamenteux, isolés de bois immergé dans des habitats tropicaux d'eau douce, ont été testées contre une souche pathogène de Candida albicans. Ces taxons ont été fermentés séparément en milieu liquide en culture pure, tandis qu'un autre ensemble a été fermenté avec l'ajout d'une souche sensible au fluconazole de Candida albicans en culture mixte. La fermentation a été effectuée en utilisant un bouillon de dextrose de pomme de terre à 25 °C pendant 28 jours, avec une lumière du jour diffuse et une agitation de 240 tr/min. Les filtrats de culture ont été testés contre une souche sensible au fluconazole et deux souches résistantes au fluconazole de C. albicans. Aucune activité antifongique contre les souches de C. albicans n'a été démontrée par les filtrats de culture obtenus à partir de la fermentation de culture pure. Dans la fermentation en culture mixte, les filtrats de culture d'une espèce non décrite de Chloridium et Sporoschisma mirabile ont produit des activités antifongiques contre les trois souches de C. albicans testées.

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Une évaluation du concept de 'morphotype' fongique basée sur des séquences d'ADN ribosomique
Dans les études sur les communautés d'endophytes fongiques, les mycelia sterilia sont généralement isolés des substrats végétaux et regroupés en morphotypes sur la base de caractéristiques culturelles. Chez Polygonum multiflorum cent soixante-neuf souches de mycelia sterilia ont été isolées et regroupées en 27 morphotypes. Six morphotypes choisis au hasard, chacun avec 2-3 représentants, ont ensuite été soumis à une analyse de séquence d'ADN ribosomique. Les similitudes de séquences nucléotidiques des régions d'espacement transcrit interne (ITS) de l'ADNr et du gène 5.8S ont été comparées à l'aide d'une analyse par grappes UPGMA. La comparaison des séquences nucléotidiques a révélé des niveaux élevés de similitude (environ 91,63 à 99,53 %) entre les souches au sein des morphotypes. Les séquences ITS et 5.8S d'espèces au sein de divers genres de GenBank ont ​​été obtenues pour estimer les niveaux de similarité de nucléotides au sein et entre des genres et des espèces bien établis. Cette étude vérifie sur la base d'une analyse de séquence d'ADN ribosomique la validité de ces « morphotypes » en tant que groupes taxonomiques. Un dendogramme illustrant la parenté des morphotypes et des taxons de référence de GenBank est également présenté.

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Évaluation de la biodiversité des myxomycètes de deux réserves forestières tropicales au Mexique
Cet article présente les résultats d'enquêtes menées dans deux réserves forestières tropicales, El Edeacuten (Quintana Roo) et Los Tuxtlas (Veracruz), au Mexique. Un total de 857 collections de myxomycètes a donné 99 taxons différents. L'une d'entre elles (Diderma yucatanensis) est décrite comme une nouvelle espèce, deux (Licea poculiformis et Stemonitis lignicola) sont de nouveaux signalements pour les Néotropiques, et 14 espèces et 2 variétés sont de nouveaux signalements pour le Mexique. Nos données confirment la présence d'un assemblage distinct de myxomycètes dans les régions tropicales et justifient l'intérêt d'utiliser la technique de la chambre humide en complément du travail de terrain dans les études de biodiversité. Ces mêmes données suggèrent également qu'un certain nombre de niches différentes sont exploitées par les myxomycètes sous les tropiques.

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Croissance et production d'acides gras des thraustochytrides des mangroves de Panay, Philippines
L'optimisation des conditions de culture en ce qui concerne les effets combinés de la salinité et de la température sur la production de biomasse et d'acides gras de quatre isolats de thraustochytrides a été entreprise. Deux souches de Schizochytrium mangrovei (IAo-1 et IXm-6) et un isolat de Schizochytrium sp. (BSn-1) et Thraustochytrium sp. (IRa-8), isolées de feuilles de mangrove tombées, ont été utilisées dans cette étude. Les résultats de l'étude physiologique montrent que la meilleure condition de croissance pour les isolats de Schizochytrium était dans une plage de salinité de 15-30 &permil à 20-30°C, tandis que celle de Thraustochytrium sp. était à 22,5-30 &permil à 25°C. La production de biomasse la plus élevée était de 350 mg 50 mL-1 pour Schizochytrium spp. et de 133 mg 50 mL-1 pour Thraustochytrium sp. La teneur totale en lipides (% de biomasse lyophilisée) variait de 16,0 à 33,2 % pour S. mangrovei, de 13,0 à 39,1 % pour Schizochytrium sp. et de 11,4 à 37,5 % pour Thraustochytrium sp. La production de lipides la plus élevée a été observée à 15-22,5 &permil de salinité (25°C) pour S. mangrovei, et à 15 &permil (25°C) pour Schizochytrium sp. et Thraustochytrium sp. L'acide palmitique (16:0) et l'acide docosahexaénoïque (DHA 22:6n3) étaient les principaux composants de la teneur totale en acides gras (TFA), comprenant environ 39-42% et 24-35%, respectivement.

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Une nouvelle espèce cyanescente de Gyroporus de Chine
Une nouvelle espèce de bolet découverte dans la province chinoise du Guangdong, Gyroporus brunneofloccosus, est formellement décrite et illustrée. Le type (HMIGD 4920) est déposé à l'Herbier de l'Institut de microbiologie du Guangdong (HMIGD), Guangzhou.

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Plusieurs champignons entopathogènes rares des montagnes du Sichuan occidental
Deux nouvelles espèces de Cordyceps et une nouvelle espèce de Paecilomyces ont été collectées respectivement dans le parc forestier de Dujiangyan, la réserve naturelle de Huanglong et Xilin Jokul. Ces nouvelles espèces sont C. sichuanensis qui parasite les adultes de Pentatomitae (Hemiptera), C. dayiensis qui a une calotte asque très fine et Paecilomyces rariramus avec des synnemata constitués de quelques rameaux et de conidies subglobuleuses.

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Une approche intégrée de l'identification taxonomique de la nouvelle souche de champignon filamenteux produisant des lipases extracellulaires : techniques morphologiques, physiologiques et d'empreintes génétiques
Une nouvelle souche de champignon filamenteux a été isolée en culture pure et initialement nommée souche L-1. La souche s'est avérée sécréter un niveau élevé de lipase extracellulaire à haute température. L'identification de l'isolat a été réalisée par la combinaison de méthodes morphologiques-physiologiques conventionnelles, de microscopie électronique à balayage et de RAPD. Les caractéristiques phénotypiques et génotypiques de la souche L-1 ont été comparées aux souches de référence. Les caractéristiques morphologiques, la vitesse de croissance radiale à différentes températures et l'ornementation de surface des sporangiospores de l'isolat correspondent presque complètement à la souche de référence Rhizopus [= microsporus var. rhizopodiformis VKM F-3693. La souche L-1 était caractérisée par un taux de croissance élevé et les capacités de maturation des spores à 50°C. Ces caractéristiques sont uniques parmi toutes les autres souches de Rhizopus. Les résultats du diagnostic RAPD indiquent le degré élevé de similarité génétique entre les souches L-1 et F-3693. Nous avons donc identifié la souche L-1 comme étant Rhizopus microsporus var. rhizopodiformis. La souche a été soumise et incluse dans la Collection panrusse de micro-organismes sous le nom de VKM F-3688.

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Typification de Spirodecospora
Une nouvelle collection d'Anthostomella melnikii a été réalisée sur l'île de Kunashir, en Russie, et s'est avérée identique à Spirodecospora bambusicola. Anthostomella melnikii devient donc le type de Spirodecospora. Cette information est officiellement publiée avec des notes sur Anthostomella melnikii et Spirodecospora bambusicola.

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Anhellia verruco-scopiformans sp. nov. (Myriangiales) associé aux balais galeux de Croton migrans au Brésil
La nouvelle espèce fongique d'Anhellia, Anhellia verruco-scopiformans associée aux balais galeux de Croton migrans d'un site de prairie montagnarde au Brésil, est décrite et illustrée.

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Première contribution à l'étude de Cryptosphaeria d'Argentine
Une nouvelle espèce de Cryptosphaeria, de la Terre de Feu en Argentine, C. sulcata, est décrite. La représentation de ce genre en Argentine est faible, seul C. lignyota et les espèces présentes sont connues. Cryptosphaeria populicola, décrite par Spegazzini, est un synonyme ultérieur d'Eutypella scoparia. Cryptosphaerina heterospora et C. cumingii, proposés par Spegazzini, sont exclus des Diatrypaceae. Les observations des asques en microscopie à fluorescence sont présentées.

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Berkleasmium typhae sp. nov., un nouvel hyphomycète sur la quenouille à feuilles étroites (Typha angustifolia) de Thaïlande
Berkleasmium typhae, collecté sur une feuille en décomposition de Typha angustifolia de Thaïlande est illustré et décrit comme une nouvelle espèce et comparé à des taxons apparentés.

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Deux nouvelles espèces de Meliola de Chine
Meliola fabri, parasite de Castanopsis fabri, et Meliola hosagoudari, parasite de Tutcheria microcarpa, sont décrites et illustrées comme de nouvelles espèces.

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Les champignons du charbon (Ustilaginomycètes) de Hyparrhenia (Poaceae)
Douze espèces de champignons du charbon sont reconnues sur le genre de graminées Hyparrhenia. Des descriptions détaillées et des synonymes avec les auteurs et le lieu de publication sont donnés pour toutes les espèces reconnues. Chaque espèce est illustrée par des dessins au trait du port et par des images LM et SEM des spores. Nouvelle espèce décrite : Sporisorium niariense Vánky. Nouveau nom proposé : Sporisorium leelingianum Vánky, remplaçant Ustilago tumefaciens Henn. Nouvelles combinaisons proposées : Sporisorium congense (Syd. & P. Syd.) Vánky, basé sur Ustilago congensis S. dembianense (Bacc.) Vánky, basé sur Sorosporium dembianense S. ischaemoides (Henn.) Vánky. (Henn.) Vánky, basé sur Sorosporium maranguense. Les noms suivants sont considérés comme des synonymes : Sorosporium tembuti Henn. & Pole-Evans est Sporisorium leelingianum Vánky Ustilago nyassae Syd. & P. Syd. est Sporisorium transfissum (Tul. & C. Tul.) G. Deml Ustilago puellaris Syd. est Sporisorium vanderystii (Henn.) Vánky. Dix autres synonymies, établies par L. Ling, sont confirmées. Les lectotypes sont désignés pour Ustilago congensis Syd. & P. Syd. [= Sporisorium congene (Syd. & P. Syd.) Vánky], Ustilago tumefaciens Henn. (= Sporisorium leelingianum Vánky), et Sphacelotheca ruprechtii Syd. [= Sporisorium vanderystii (Henn.) Langdon & complet.]. Une clé de l'espèce et une liste d'hôtes-parasites sont fournies pour faciliter l'identification des champignons du charbon Hyparrhenia.

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Microchampignons sur les Pandanaceae : Zygosporium, une revue du genre et deux nouvelles espèces
Zygosporium pacificum sp. nov. et Z. pandanicola sp. nov. sont introduits sur la base de spécimens identifiés sur des feuilles de Pandanus collectés dans les nations insulaires du Pacifique de Niue et Vanuatu, et aux Philippines, respectivement. Les deux espèces sont comparées aux espèces actuellement acceptées et une clé du genre est fournie. Des spécimens de Z. echinosporum, Z. gibbum, Z. minus et Z. oscheoides ont également été collectés sur des membres de Pandanaceae.

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Obeliospora minima sp. nov. et quatre autres hyphomycètes avec des appendices portant des conidies
Cinq hyphomycètes dématiés avec des sétules portant des conidies, Obeliospora minima sp. nov., O. basicpira, Bahusutrabeeja dwaya, Nawawia filiformis et Phialosporostilbe setosa, sont décrits et illustrés. Obeliospora minima diffère des deux espèces connues du genre, O. basicpira et O. triappendiculata, par ses conidies plus petites avec seulement 3 sétules. Tous ces genres et espèces sont signalés pour la première fois en Chine.


Champignons d'eau douce du bambou et du bois submergés dans la rivière Liput aux Philippines
Quatre-vingts champignons ont été enregistrés sur du bambou et du bois submergés dans la rivière Liput, Bario Alegria, Negros Occidentalis, Philippines, suite à des collectes effectuées en avril 1997 et août 2001. La fréquence d'apparition de ces champignons a également été étudiée. L'espèce la plus commune dans l'ensemble était Didymella aptrootii, présente sur 23,5% des échantillons, tandis qu'Astrosphaerella papillata (19,5%) et Acrogenospora sphaerocephala (14,5%) étaient également communes. L'espèce la plus commune sur bambou était Didymella aptrootii, présente dans 39,2 % des échantillons, tandis que l'espèce la plus commune sur bois était Savoryella aquatica (18,7 %).Le nombre moyen d'espèces identifiées dans chaque échantillon était de 2,28, ce qui indique une diversité fongique relativement élevée dans la rivière Liput. Les communautés fongiques sur le bambou et le bois submergés sont comparées et discutées. Les résultats ont montré que, dans la rivière Liput, le bambou supporte un groupe de champignons différent et diversifié par rapport au bois. La communauté fongique sur le bambou submergé est, dans une certaine mesure, similaire à celle sur le bambou terrestre dans les études précédentes. Les raisons possibles sont discutées.

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Dégradation de la paroi cellulaire des graminées par les cellulases et hémicellulases fongiques
Il y a eu un intérêt accru pour la conversion microbienne et enzymatique des matières premières renouvelables en produits utiles, tels que les aliments pour animaux, les produits chimiques et l'énergie. Les enzymes impliquées dans ces conversions ont des applications commerciales potentielles dans des domaines assez différents. Un ascomycète intéressant capable de convertir jusqu'à 30 % et 55 % des composants de la paroi cellulaire des graminées après 7 et 21 jours respectivement, a été isolé au cours d'un programme de dépistage des micro-organismes dégradant la paroi cellulaire des graminées. Ce champignon peut constituer une source intéressante de nouvelles xylanases et cellulases, puisque d'autres substrats cellulosiques et hémicellulosiques, tels que la cellulose microcristalline, le coton, le papier et le xylane ont également été convertis. Par exemple, un journal non imprimé (20g/L) a été complètement solubilisé en 4-5 jours à 30ºC. Selon le type de substrat cellulosique ou hémicellulosique, utilisé comme source de carbone dans le milieu de croissance, les profils de synthèse enzymatique différaient considérablement, non seulement le niveau d'activité enzymatique différait, mais aussi le type d'enzyme produit différait. Les profils de pH et de température des activités enzymatiques fongiques présentes dans le surnageant brut ont été déterminés. La plupart des enzymes fonctionnaient de manière optimale à 50-60°C et à pH neutre. La stabilité thermique des enzymes a été comparée à 30ºC et 60ºC. L'ajout de glycérol (30 % p/v) a stabilisé certaines des enzymes de l'inactivation thermique. La conversion de différents substrats par le surnageant brut a été suivie par une analyse HPLC des mono- et oligosaccharides libérés. Le degré de conversion le plus élevé a été observé avec des substrats tels que le papier journal non imprimé (72 %), le xylane (61 %), la carboxyméthylcellulose (60 %), le papier Whatmann (53 %) et le coton (44 %). La cellulose microcristalline et l'herbe ont été hydrolysées dans une moindre mesure. Une caractérisation plus poussée de ces enzymes est maintenant en cours, ainsi que l'identification taxonomique de l'ascomycète.

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Surveillance et sauvegarde des ressources fongiques dans le monde : la nécessité d'un plan international collaboratif MycoAction
Le défi de surveiller et de sauvegarder les ressources fongiques d'Earth´s est un défi de taille auquel il faut faire face. Avec seulement 74-120 K des 1,5 million d'espèces fongiques estimées sur la planète décrites et des ressources humaines et financières limitées, comment pouvons-nous identifier les domaines prioritaires à la fois pour la recherche systématique et la conservation ? De plus, à quel équilibre doit-on aspirer entre la conservation in situ et ex situ, et comment cela doit-il être reflété dans les politiques nationales et internationales ? La mycologie est trop discrète et reste orpheline au sein de la botanique et de la microbiologie, comment changer cette perception ? Les systèmes en place pour éduquer les nouvelles générations de mycologues sont également défaillants, comment y remédier ? Alors que les contacts entre les mycologues aux niveaux national, régional et mondial se sont remarquablement améliorés au cours des deux dernières décennies, une action concertée à une échelle jusqu'ici non tentée est nécessaire pour répondre à ces questions fondamentales. Certaines actions à inclure dans une nouvelle initiative internationale potentielle conçue pour commencer à remédier à certains de ces problèmes clés sont suggérées. Les propositions comprennent des actions devant être entreprises par des individus jusqu'à celles qui méritent d'être couvertes par des traités internationaux intergouvernementaux : nombre d'entre elles sont accompagnées d'objectifs et d'échéances. Cette contribution est destinée à servir de projet de plan d'action (MycoAction Plan) pour discussion, élaboration et révision par l'ensemble de la communauté mycologique - travaillant sous les auspices de l'International Mycological Association (IMA). Il est prévu qu'il y aura des plans d'action du monde entier (MycoAction Worldwide Plan) au personnel (MycoAction Personal Plan).

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Une hypothèse phylogénétique cox2 pour le mildiou et la rouille blanche
Des séquences de cox2 codées dans les mitochondries ont été utilisées pour déduire les relations évolutives des taxons de mildiou et de rouille blanche dans un ensemble de données de 36 isolats de péronosporomycètes. L'ensemble de données de 599 nucléotides alignés a été analysé en utilisant la jointure voisine, la parcimonie maximale et la probabilité maximale. Ces analyses phylogénétiques n'ont pas inféré d'ordres monophylétiques distincts pour les Pythiales par rapport au mildiou (Peronosporales), mais indiquent que la séparation des mildious infectant les monocotylédones et les dicotylédones en sous-classes distinctes n'est pas justifiée. Les analyses de trois espèces d'Albugo, cependant, en déduisent que les Peronosporales sont un groupe polyphylétique, à moins que cet ordre ne soit élargi pour inclure les espèces des Pythiales et des Rhipidiales. Alors que toutes les séquences d'acides aminés du mildiou cox2 examinées portaient la signature indel LEF/Y caractéristique de la sous-classe des Peronosporomycetidae, les trois espèces d'Albugo n'en avaient pas. Au lieu de cela, l'indice de signature LEF/Y a été remplacé par un indice hautement variable unique à chaque espèce d'Albugo. Collectivement, ces résultats indiquent que les rouilles blanches ne sont que de loin apparentées au mildiou et constituent un ordre basal distinct des autres ordres au sein des Peronosporomycetidae.

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La mycologie et son avenir dans la région Asie
Pour remplir leurs engagements envers la Convention sur la diversité biologique (CDB), les pays de la région asiatique doivent comprendre que l'expertise taxonomique est vitale pour une mise en œuvre efficace. La Global Taxonomy Initiative (GTI) déclare donc que « comprendre la taxonomie est une priorité dans la mise en œuvre de la CDB ». Les champignons, en particulier, sont un groupe d'organismes où les pays de la région manquent de taxonomistes pour répondre aux exigences de la CDB. Auparavant, plusieurs pays asiatiques avaient des groupes de taxonomistes actifs dans l'étude des champignons, mais ces dernières années, le nombre de mycologues a diminué en raison d'autres engagements, d'une retraite sans remplacement et d'une plus grande importance accordée à d'autres disciplines, telles que la biotechnologie. Cet article passera brièvement en revue l'histoire de l'étude des champignons dans la région asiatique, puis examinera la situation actuelle à travers une analyse des publications dans des revues internationales. Il abordera les effets du CBD sur la recherche taxonomique mycologique dans la région. Il se penchera ensuite sur l'avenir de la mycologie taxonomique en Asie ? Des suggestions sur la façon d'améliorer l'expertise mycologique dans un pays sont données, avec une référence particulière aux succès de Hong Kong et de la Thaïlande.

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Champignons tolérants aux alcalins de Thaïlande
Une collection de 490 champignons tolérants aux alcalins a été constituée en isolant des champignons d'habitats naturels à l'aide de boîtes de Pétri avec un milieu Potato Dextrose Agar tamponné à pH 11,0. Des champignons tolérants aux alcalins ont été isolés de 51 des 71 échantillons collectés dans différents habitats en Thaïlande. Vingt-huit échantillons ont été prélevés dans des trous d'arbres avec des pH différents. Les autres étaient des échantillons de sol et de sable, de bois, de graines, de trous dans la roche, de racines, de feuilles ou de divers autres substrats. Un total de 324 souches (66 %) ont été criblées pour les enzymes qui étaient actives à pH alcalin (enzymes alcalines). L'activité de l'arabinanase, de l'amylase, de la galactanase de la pomme de terre et de la protéase a été testée. Les champignons tolérants aux alcalins isolés de trous d'arbres dans des habitats alcalins et acides étaient de bonnes sources pour la production d'enzymes alcalines. Ce criblage démontre qu'il existe une population de champignons capables de tolérer un pH élevé. Il est important de noter que les champignons tolérants aux alcalins ont été isolés des environnements acides. Les habitats d'eau douce semblent être une bonne source de champignons avec une capacité de production d'enzymes alcalines.

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Clonage du gène de la phytase phyA d'Aspergillus ficuum 3.4322 et son expression dans la levure
Un gène phyA a été cloné à partir d'Aspergillus ficuum 3.4322 par amplification en chaîne par polymérase de transcription inverse. Le fragment amplifié a été cloné dans le vecteur T pMD18 et séquencé. L'analyse de la séquence nucléotidique du gène phyA a montré qu'il comprenait 1347 pb sans la séquence du peptide signal et code pour un polypeptide de 448 acides aminés. La séquence phyA a été déposée dans GenBank (numéro d'accès : AF537344). Les vecteurs d'expression pYPA1 et pYPA2 ont été construits en clonant le gène phyA avec et sans la séquence de peptide signal dans le vecteur d'expression de levure pYES2. Les plasmides recombinants ont été transformés dans Saccharomyces cerevisiae INVSc1 par la méthode de LiAc. L'activité phytase a été trouvée dans le fluide endocellulaire pYPA2 (environ 11,55 UI/ml) et dans le surnageant pYPA1 (environ 11,60 UI/ml) par induction de galactose. Les résultats ont démontré que le gène phyA avait été exprimé chez Saccharomyces cerevisiae et que la séquence signal d'Aspergillu ficuum3.4322 pouvait faciliter efficacement la sécrétion de phytase de S. cerevisiae.

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Exemples phylogénétiques de la biodiversité asiatique chez les champignons et leurs parents
En utilisant des caractères de la morphologie, des systèmes de reconnaissance sexuelle, du séquençage de l'ADN et des modèles RFLP, des modèles géographiques et des directions de migration géographique peuvent être déterminés. Dans les groupes fongiques tels que Artomyces (Clavicorona), Flammulina, Lentinus, Panellus et Pleurotus, quatre principes peuvent être élucidés : 1) pour certains groupes sexuellement compatibles, une cohésion eurasienne évidente peut être identifiée, par opposition à une population américaine sœur 2) pour certains groupes, une forte cohésion Asie-ouest nord-américaine peut être identifiée 3) il faut prendre soin de distinguer une migration relativement ancienne des événements récents, ces derniers parfois d'origine humaine et 4) de nombreuses populations ancestrales sexuellement intercompatibles existaient avant la dérive continentale ultime, plus tard devenant allopatrique mais conservant une reconnaissance sexuelle. La reconnaissance sexuelle parmi les populations intercontinentales semble être une mesure de parenté plus fiable que les caractères morphologiques et (dans une certaine mesure) les mutations de la séquence d'ADN.

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Structure de la population d'Ascochyta rabiei en Australie basée sur les empreintes digitales STMS
Dix-neuf paires d'amorces de sites microsatellites marqués par séquence (STMS) ont été utilisées pour déterminer la structure génétique au sein d'une population australienne d'Ascochyta rabiei collectée à Victoria, en Australie-Méridionale, en Australie-Occidentale et en Nouvelle-Galles du Sud. Aucun des allèles trouvés en Australie n'a montré de différences significatives dans les fréquences d'allèles ou n'était à un déséquilibre des gamètes. Un très faible niveau de diversité génétique (Ht = 0,02) a été trouvé au sein de la population australienne, la majorité de la diversité (92 %) étant répartie au sein des sous-populations. En revanche, une grande diversité a été détectée parmi les isolats internationaux (Ht = 0,45), 22 % étant attribués à la différenciation entre les pays. Sur les 20 loci évalués, 16 étaient homozygotes dans la population australienne, et le flux génétique de quatre loci hétérozygotes était élevé. Sur les sept génotypes identifiés au sein de la population australienne, un a été trouvé dans toutes les sous-populations australiennes et représentait 82,9% du total des isolats testés. Les populations canadienne et américaine se ressemblaient davantage que les populations australienne ou syrienne. Les résultats de cette étude seront utiles pour la sélection de cultivars résistants au pois chiche et pour l'élaboration des réglementations de quarantaine nécessaires.

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Premier signalement d'un champignon charbonnier sur Byblidaceae : Yelsemia lowrieana une nouvelle espèce d'Australie
Yelsemia lowrieana sp. nov. (Ustilaginomycetes) est décrit et illustré à partir de Byblis rorida collecté dans le nord-ouest de l'Australie occidentale. Les plantes infectées avaient des galles remplies de spores sur les tiges et les pédicelles. Les spores étaient inhabituelles en ce sens que chacune pouvait être séparée d'une paroi externe sombre des spores. Il s'agit du premier signalement d'un champignon du charbon sur la famille d'hôtes dicotylédones Byblidaceae.

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Biodiversité des champignons charbonniers australiens
Il existe environ 250 espèces de champignons du charbon connus en Australie, dont 95 sont endémiques. Quatorze de ces espèces endémiques ont été collectées pour la première fois au cours de la période culminant avec la publication de la révision de Daniel McAlpine sur les champignons du charbon australien en 1910. Sur les 68 espèces traitées par McAlpine, 10 étaient considérées comme endémiques d'Australie à cette époque. Seulement 23 des espèces traitées par McAlpine ont des noms actuellement acceptés. Au cours des quatre-vingts années suivantes jusqu'en 1990, 31 autres espèces endémiques ont été collectées et seulement 11 d'entre elles ont été nommées et décrites au cours de cette période. Depuis 1990, 50 autres espèces de champignons du charbon endémiques ont été collectées et nommées en Australie. Il existe 115 espèces qui sont limitées soit à l'Australie, soit à l'Australie et aux pays voisins de l'Indonésie, de la Nouvelle-Zélande, de la Papouasie-Nouvelle-Guinée et des Philippines. Ces 115 espèces endémiques se retrouvent dans 24 genres, à savoir Anthracoidea (1 espèce), Bauerago (1), Cintractia (3), Dermatosorus (1), Entyloma (3), Farysporium (1), Fulvisporium (1), Heterotolyposporium (1) , Lundquistia (1), Macalpinomyces (4), Microbotryum (2), Moreaua (20), Pseudotracya (1), Restiosporium (5), Sporisorium (26), Thecaphora (2), Tilletia (12), Tolyposporella (1) , Tranzscheliella (1), Urocystis (2), Ustanciosporium (1), Ustilago (22), Websdanea (1) et Yelsemia (2). Environ la moitié de ces espèces endémiques locales et régionales se trouvent sur les graminées et un quart sur les carex. La région de savane tropicale du nord de l'Australie est la plus prometteuse pour la découverte de nouvelles espèces endémiques. L'importance agricole, de quarantaine et environnementale pour l'Australie de certaines espèces introduites est discutée.

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Arômes et parfums biologiques via les champignons et leurs enzymes
De nombreux champignons et levures se sont avérés produire des composés odorants de novo. Les espèces Ceratocystis et les levures Kluyveromyces lactis et Sporidiobolus salmonicolor produisent une large gamme de terpènes et lactones aux saveurs fruitées ou florales. La levure Williopsis saturnus synthétise de novo des arômes d'esters fruités (c'est-à-dire des acétates ramifiés volatils). Geotrichum klebahnii produit également un large spectre d'esters éthyliques d'acides carboxyliques ramifiés, générant une agréable saveur fruitée. En outre, les acides gras de spécialité précurseurs et les AGPI peuvent être convertis par des champignons (tels que Penicillum sp. et Botryodiplodia sp.) en composés aromatiques, qui fournissent des "notes vertes", une saveur de champignon, des lactones fruitées et des méthylcétones aromatisées au fromage. De même, un processus fongique en deux étapes a été développé, par lequel Aspergillus niger transforme l'acide férulique en acide vanillique, que les basidiomycètes tels que Pycnoporus cinnabarinus ou Phanerochaete chrysosporium peuvent ensuite convertir en vanilline. Des arômes de furanone sont présents dans de nombreux fruits, mais ont également été détectés dans des cultures microbiennes. Dans ce contexte, la levure de sauce de soja Zygosaccharomyces rouxii forme le composé DMHF-furanone à partir du glucose, lorsqu'elle est alimentée avec du fructose-1,6-biphosphate. Outre les processus de fermentation précurseurs, des systèmes enzymatiques sont également en cours de développement pour produire des arômes, c'est-à-dire que l'alcool déshydrogénase de levure peut convertir la 1-phényl-2-propanone en (S)-1-phényl-2-propanol in vitro La régénération des co-enzymes reste souvent un goulot d'étranglement . Les levures telles que Torulopsis bombicola et Candida tropicalis peuvent convertir les acides gras ou les alcanes en précurseurs de parfum de musc. Ces exemples indiquent qu'une coopération interdisciplinaire entre les microbiologistes, les biochimistes, les chimistes organiques et les ingénieurs en bioprocédés est nécessaire pour développer des découvertes de laboratoire intéressantes dans des processus économiques de production d'arômes biologiques.

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Cintractiellacées fam. nov. (Ustilaginomycètes)
Une nouvelle famille, les Cintractiellaceae, est proposée pour accueillir les deux champignons du charbon particuliers du genre Cintractiella, C. diplasiae et C. lamii.

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Les Xylariales : un ordre monophylétique comprenant 7 familles
Un certain nombre de classifications souvent contradictoires, basées sur la morphologie, ont été suggérées pour les Xylariales. Cependant, aucune tentative n'a été faite auparavant pour tester ces classifications en utilisant des données moléculaires. Les relations phylogénétiques de 6 familles acceptées des Xylariales (Amphisphaeriaceae, Clypeosphaeriaceae, Diatrypaceae, Graphostromataceae, Hyponectriaceae et Xylariaceae) ainsi que des membres des Apiosporaceae, ont été étudiées à l'aide d'analyses individuelles et combinées de fragments de gènes d'ADNr 28S et 18S. Les analyses ont été menées en utilisant des critères de parcimonie maximale et pondérée et de vraisemblance. Les Xylariales se sont avérés être un ordre monophylétique contenant les 7 familles ci-dessus. Cependant, les données d'ADNr 28S et 18S se sont avérées inadéquates pour déterminer les relations familiales au sein de l'ordre. Cette découverte est contraire à la plupart des autres études sur la systématique des ascomycètes utilisant ces gènes particuliers.

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Enzymes ligninolytiques des Xylariaceae endophytes tropicales
Cet article se concentre sur la production d'enzymes ligninolytiques par 581 souches endophytes de Xylariaceae isolées de plantes tropicales indigènes saines du nord de la Thaïlande. La souche CMUX144 s'est avérée être la meilleure productrice de peroxydase indépendante du manganèse. L'effet du pH, de la température, de la concentration initiale en glucose et de la concentration en tartrate d'ammonium sur la production d'enzymes par cette souche a été étudié. Une activité de 195 U/l a été atteinte après 6 jours de culture dans des conditions optimales. L'activité enzymatique a atteint 292 U/l lorsque le milieu a été additionné d'alcool vératrylique. La décoloration du Poly R-478 à divers rapports C/N dans les milieux a été étudiée. La décoloration biologique après 12 jours de culture était supérieure à 91 %.

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La montée et la chute du dépistage des produits naturels pour la découverte de médicaments
Sur les 520 nouveaux médicaments approuvés entre 1983 et 1994, 39 % étaient des produits naturels ou dérivés de produits naturels. Neuf des 20 médicaments non protéiques les plus vendus en 1999 étaient dérivés ou développés à la suite de prospects générés à partir de produits naturels, et avaient des ventes annuelles de 16 milliards de dollars US. Quarante pour cent des échafaudages chimiques trouvés dans une base de données publiée de produits naturels sont absents de la chimie de synthèse. Malgré ces chiffres impressionnants, l'engouement pour le criblage d'extraits de produits naturels a connu des hauts et des bas depuis plusieurs années. Ces dernières années, la disponibilité de grandes bibliothèques de composés produits par la chimie combinatoire et la pression pour raccourcir les délais de découverte de plomb ont signalé un autre déclin de l'intérêt pour les extraits de produits naturels en raison de la « difficulté » de travailler avec ces mélanges complexes de composés. Cependant, un certain nombre d'approches ont été adoptées par les entreprises pour améliorer la vitesse et, plus important encore, l'efficacité du dépistage des produits naturels. En conséquence, l'utilisation de produits naturels dans les programmes de découverte de médicaments industriels connaît actuellement une renaissance, car certaines des difficultés qui étaient traditionnellement associées à l'utilisation de produits naturels dans les programmes de criblage à haut débit sont surmontées. En outre, la dynamique de l'activité de criblage de médicaments a été affectée par la consolidation de grandes sociétés pharmaceutiques, l'impact du séquençage des gènes et l'augmentation des cibles et des technologies de criblage.Certains de ces changements et leurs effets sur le dépistage des produits naturels sont également décrits.

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Biodiversité des champignons mycorhiziens arbusculaires dans les forêts tropicales humides du Xishuangbanna, sud-ouest de la Chine
Les forêts tropicales humides du Xishuangbanna dans le sud-ouest de la Chine sont situées à la limite nord des forêts tropicales humides d'Asie du Sud-Est. Ils abritent une grande diversité d'animaux et de plantes. Nous avons étudié la diversité des champignons mycorhiziens arbusculaires dans le sol sous les arbres de ces forêts afin d'établir si ces champignons sont également très divers. Cent dix-huit échantillons de sol de rhizosphère ont été collectés dans une forêt tropicale humide du Xishuangbanna, et 525 échantillons de spores fongiques mycorhiziennes arbusculaires (ou sporocarpes) ont été obtenus par la méthode du tamis humide. Vingt-sept espèces de champignons mycorhiziens arbusculaires ont été identifiées dans les collections. Les espèces de champignons mycorhiziens arbusculaires appartenaient aux genres Acaulospora (9 espèces), Gigaspora (1 espèce), Glomus (13 espèces), Sclerocystis (3 espèces) et Scutellospora (1 espèce). Acaulospora et Glomus étaient dominants sur le site d'étude. La densité de spores des champignons mycorhiziens arbusculaires variait de 25 à 2550 pour 100 g de sol (moyenne 675), et la richesse spécifique des champignons mycorhiziens arbusculaires variait de 1 à 7 (moyenne 4,4). Bien que les forêts tropicales humides abritent une grande diversité de plantes, leurs champignons symbiotiques associés ne sont pas aussi diversifiés que prévu, peut-être parce que les champignons mycorhiziens à arbuscules ne sont pas spécifiques à leurs plantes hôtes.



Nouveaux microlichens de Taïwan
À la suite d'un voyage sur le terrain de trois semaines à Taïwan en 2001, 288 espèces de microlichens et d'ascomycètes apparentés sont signalées. Tous sont nouveaux à Taïwan, et la plupart sont jusqu'à présent inconnus de la Chine continentale. Parmi celles-ci, 83 espèces sont nouvelles en Asie de l'Est et 41 n'ont jamais été signalées en Asie. Cela comprend les espèces suivantes nouvelles pour la science : Arthonia parantillarum, Rimularia gyromuscosa, Rinodina placynthielloides, R. pluriloculata (décrite de Chine continentale), R. punctosorediata et Vezdaea flava. (Voir PDF)

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Identification des espèces biologiques d'Armillaria en Iran
Trente-quatre isolats d'Armillaria ont été collectés à partir d'une variété d'hôtes dans des vergers et des régions forestières d'Iran. A partir de chaque basidiocarpe, des cultures de monospores ont été obtenues. Les cultures haploïdes et diploïdes ont été appariées dans toutes les combinaisons "haploïdes-haploïdes" et "diploïdes-haploïdes" possibles. La compatibilité sexuelle a été déterminée après 25-35 jours sur la base des différences dans la morphologie de la culture des colonies haploïdes allant du blanc, avec du mycélium aérien (duveteux) au brunâtre, sans mycélium aérien (croûteux) qui est caractéristique des cultures diploïdes. Six groupes de compatibilité nommés groupes d'interstérilité iraniens (IISG) ont été identifiés : IISG1 comprenait un isolat, IISG2 dix-sept isolats, IISG3 huit isolats, IISG4 un isolat, IISG5 deux isolats et IISG6 cinq isolats. Des isolats haploïdes et diploïdes provenant de groupes d'interstérilité iraniens d'Armillaria ont été jumelés à des souches testeuses haploïdes européennes et japonaises. Six groupes d'interstérilité ont été authentifiés comme A. mellea, A. cepistipes, A. gallica, A. borealis, Armillaria sp. (IISG5) et Armillaria sp. (IISG6). Cependant, deux groupes (IISG5 et IISG6) n'étaient compatibles avec aucune des souches d'essai représentant différentes espèces. (Voir PDF)

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Xenosporium amomi sp. nov. de Zingiberaceae en Thaïlande
Xenosporium thaxteri et une espèce non décrite de Xenosporium ont été trouvés comme saprobes sur des pseudotroncs morts d'Alpinia malaccensis et d'Amomum siamense dans le parc national de Doi Suthep-Pui, Chiang Mai, Thaïlande. La nouvelle espèce, X. amomi est décrite, illustrée et comparée à des espèces similaires de Xenosporium. Les caractères diagnostiques des 14 espèces acceptées de Xenosporium sont fournis et le genre est passé en revue sur la base de la littérature. (Voir PDF)

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Un examen des taxons Spegazzini de Periconia et Sporocybe après plus de 115 ans
Certains groupes ou genres décrits par Spegazzini n'ont jamais été réexaminés. Dans cet article, le matériel type des espèces Sporocybe et Periconia décrit par Spegazzini est étudié. Le genre Periconia est représenté en Argentine par sept espèces : P. bromeliicola, P. byssoides, P. circinata, P. lateralis, P. minutissima, P. spegazzinii et P. tirupatiensis. Parmi les holotypes de Sporocybe de Spegazzini, S. bromeliicola est considéré comme un nomen dubium, S. antarctica est un lichen, S. chlorocephala est un synonyme de Stromatographium stromaticum, Sporocybe penicillata est un synonyme de Melanographium spinulosum et S. saccharycus est un synonyme pur de Doratomographium stromaticum. . Doratomyces est représenté par quatre espèces : D. asperulus, D. microsporus, D. purpureofuscus et D. stemonitis, dont trois sont signalées sous ce genre pour la première fois. (Voir PDF)

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Pseudocercospora siraitiae sp. nov. (hyphomycètes) sur feuilles de Siraitia cf. siamensis (Cucurbitacées) en Chine
Une nouvelle espèce de Pseudocercospora a été trouvée sur des feuilles de Siraitia cf. siamensis (Cucurbitaceae) dans la province du Yunnan, dans le sud-ouest de la Chine. Le champignon diffère des espèces connues sur les hôtes cucurbitacés par ses conidies courbes et ses longs conidiophores issus du mycélium superficiel. Les espèces de Siraitia n'ont jusqu'à présent été signalées comme plantes hôtes d'aucun champignon cercosporoïde. Par conséquent, P. siraitiae est proposé comme une nouvelle espèce. Une clé des espèces de Pseudocercospora sur les hôtes cucurbitacés est également fournie. (Voir PDF)

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Changements temporels dans la prévalence de trois espèces de Trichomycètes (Zygomycota : Zygomycotina) chez les larves aquatiques de Diptères d'Argentine
Les trichomycètes (champignons) habitent le tube digestif des insectes et autres arthropodes. Trois espèces de Harpellales (Zygomycotina : Trichomycetes) ont été collectées sur le terrain à partir de larves de diptères à La Plata, en Argentine tous les 15 jours pendant 1,5 an de 1999 à 2000. Enregistrements de l'occurrence des larves d'insectes hôtes, Dasyhelea necrophila (Ceratopogonidae), Chironomus sp. (Chironomidae) et Culex pipiens (Culicidae), et la prévalence de leurs Harpellales, Carouxella coemeteriensis, Stachylina platensis et Smittium culisetae associés, sont présentés. Les champignons étaient quelque peu saisonniers, étant présents pendant l'automne, l'hiver et le printemps. Leur abondance semble dépendre de la densité d'hôtes. (Voir PDF)

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Le genre Cordyceps et ses alliés de la réserve Kuankuoshui du Guizhou III
Quatre nouvelles espèces du genre Cordyceps de la réserve de Kuankoushui dans la province du Guizhou sont décrites. Ce sont Cordyceps furcicaodata, C. dermapterogena, C. cylindrostromata et C. rostrata. De plus, Cordyceps formicarum et C. takaomontana sont signalés pour la première fois dans la province du Guizhou, en Chine. Les spécimens examinés ont été déposés au Laboratoire des ressources fongiques, Université du Guizhou (LFRGU).(Voir PDF)

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Dactylella shizishanna sp. nov., de Shizi Mountain, Chine
Une nouvelle espèce, Dactylella shizishanna, est décrite dans la province du Hubei, en Chine, et comparée aux espèces similaires de Dactylella crassa. Une clé des espèces de Dactylella produisant des filets adhésifs est donnée. (Voir PDF)

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Diversité des champignons filamenteux sur litière ligneuse de cinq espèces de plantes de mangrove de la côte sud-ouest de l'Inde
La diversité fongique sur le bois intertidal en décomposition de cinq espèces de plantes de mangrove (Acanthus ilicifolius, Avicennia officinalis, Bruguiera gymnorrhiza, Rhizophora mucronata et Sonneratia caseolaris) accumulées sur le sol du peuplement de mangrove d'Udyavara sur la côte sud-ouest de l'Inde a été étudiée. Des échantillons de bois collectés pendant la mousson et la saison estivale ont été incubés dans des chambres humides et observés une fois toutes les deux semaines pendant jusqu'à six mois. Quatre-vingt-onze champignons appartenant à 68 genres ont été récupérés. Les champignons terrestres étaient dominants pendant la saison des moussons, tandis que les champignons marins étaient dominants pendant l'été. La richesse et la diversité fongiques étaient plus élevées pendant la mousson qu'en été. Rhizophora mucronata a montré l'indice de Simpson le plus élevé aux deux saisons. L'indice de Shannon était le plus élevé pour Rhizophora mucronata pendant la mousson, alors qu'il était le plus élevé pour Bruguiera gymnorrhiza pendant l'été. La raréfaction a montré que le nombre d'espèces attendu le plus élevé sur 150 identifications était celui de Rhizophora mucronata pendant la saison de la mousson (43 contre 27-38 espèces), alors qu'il était le plus élevé chez Sonneratia caseolaris pendant l'été (25 contre 20-23 espèces). Un nombre maximum d'espèces par échantillon a été observé sur Bruguiera gymnorrhiza (mousson, 2,9 été, 3). Des différences significatives dans la diversité des espèces et le nombre attendu d'espèces entre les saisons ont été observées (test t). Lignincola laevis, Savoryella lignicola et Trichocladium linderi ont été trouvés au cours des deux saisons sur tous les substrats. Lignincola laevis, Passeriniella mangrovei, Savoryella lignicola, S. paucispora, Trichocladium achrasporum et T. linderi étaient dominants pendant la mousson (> 10 %), tandis que Cirrenalia pygmea, Lignincola laevis, Lulworthia grandispora étaient, Nais sp., Savoryella lignicola lignicola dominante pendant l'été. Il est probable que les champignons terrestres, d'eau douce et aéro-aquatiques trouvent des conditions idéales pour leur développement dans les mangroves pendant la saison de la mousson sur la côte ouest de l'Inde. (Voir PDF)

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Abondance et diversité des champignons marins sur la litière ligneuse intertidale de la côte ouest de l'Inde en incubation prolongée
Du bois intertidal a été collecté dans quatre localités côtières de la côte ouest de l'Inde pendant la saison post-mousson pendant deux années consécutives. Les échantillons ont été évalués pour la présence de champignons marins filamenteux à différents intervalles d'incubation en laboratoire (0, 2, 6, 12 et 18 mois). Sur les 59 taxons identifiés, 43 étaient des ascomycètes, trois basidiomycètes et 13 champignons anamorphiques. Une incubation de six mois a donné jusqu'à 66% du total des taxons rencontrés. Les taxons trouvés exclusivement pendant des périodes d'incubation spécifiques étaient les plus élevés pendant les 6 ou 12 mois d'incubation. Dans l'ensemble, Torpedospora radiata était le champignon prédominant (11,6 à 21,5%), tandis qu'Aniptodera chesapeakensis, Antennospora quadricornuta, Caryosporella rhizophorae, Corollospora intermedia, C. maritima, Crinigera sp., Dictyosporium pelagicum, Didymosphaeria sp., Halocyphina villosa, varium étaient fréquents (>5%). Ces champignons ont atteint la fréquence d'occurrence la plus élevée après 12 ou 18 mois d'incubation. La richesse et la diversité fongiques étaient les plus élevées après six mois d'incubation. La diminution de l'indice de similarité de Jaccard de deux mois à 18 mois d'incubation indique que des taxons supplémentaires se produisent lors d'une incubation prolongée. L'incubation du bois intertidal des plages tropicales jusqu'à 18 mois semble être une période adéquate pour une évaluation raisonnable de la diversité fongique marine. (Voir PDF)

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Deux nouvelles espèces de Dactylaria (champignons anamorphiques) et une mise à jour des espèces de Dactylaria sensu lato
Les nouvelles espèces Dactylaria belliana et D. ficusicola ont été isolées de la litière de feuilles d'une forêt tropicale humide australienne. Dactylaria belliana diffère des autres espèces de ce genre par des conidies étroitement fusiformes et uniseptées et des conidiophores pigmentés et denticulés. Dactylaria ficusicola est similaire en morphologie à D. hemibeltranioidea mais diffère en ne produisant que des conidies cylindriques étroites alors que cette dernière espèce a également des conidies fusiformes et naviculées. Les nouvelles espèces sont décrites et illustrées ici. Un synopsis des espèces décrites dans Dactylaria sensu de Hoog depuis la revue de Goh et Hyde (1997) est fourni sur la base de la littérature. (Voir PDF)

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Quatre nouvelles espèces d'Asterina du Yunnan, Chine
Asterina flacourtiaceicola parasite de Flacourtiaceae indet., Asterina horsfieldiicola parasite de Horsfieldia glabra (Myristicaceae), Asterina phoebicola parasite de Phoeba lanceolata (Lauraceae) et Asterina stixis parasite de Stixis suaveolens (Capparidaceae) espèces sont décrites et illustrées en tant que nouveau PDF.

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Diversité des champignons sur les fruits sauvages à Hong Kong
Dix-huit espèces de fruits sauvages ont été examinées à la recherche de champignons responsables de la décomposition des fruits dans la nature. Les fruits stérilisés en surface et non stérilisés ont été incubés pendant 1 à 4 semaines et les fructifications ont été identifiées. Un total de 540 échantillons et 495 microchampignons de 102 taxons ont été identifiés. Colletotrichum et Phomopsis étaient les genres fongiques les plus fréquemment enregistrés. Ilex cinerea avait les espèces fongiques les plus diverses, tandis que Wikstroemia nutans avait la plus faible diversité. Cinquante-huit pour cent des genres fongiques trouvés dans cette enquête n'ont pas été enregistrés sur des fruits cultivés. La communauté fongique qui s'est développée sur les fruits non stérilisés après incubation était généralement plus diversifiée que sur les fruits stérilisés en surface, mais les deux étaient principalement colonisés par des champignons non spécifiques. Les espèces fruitières apparentées n'avaient pas, en général, plus de communautés fongiques similaires que les espèces non apparentées. La capacité des fruits détachés à résister aux infections fongiques pendant l'incubation variait considérablement, 77% des fruits de Wikstroemia nutans n'étant toujours pas infectés après 4 semaines. Les champignons ont été classés en trois types : les agents pathogènes, les opportunistes latents et les opportunistes à colonisation rapide. Les opportunistes à colonisation rapide, tels que Cladosporium, Fusarium et Penicillium, étaient les taxons les plus importants sur les fruits sauvages. (Voir PDF)

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Les endophytes en Asie du Sud-Est et au Japon : leur diversité taxonomique et leurs applications potentielles
Les endophytes ont été isolés en plaçant des parties de plantes sur de la gélose après un lavage poussé à l'eau courante du robinet et une stérilisation par trempage dans 75 % d'éthanol et 5,3 % d'hypochlorite de sodium. Quatre cent deux plantes, dont des plantes endémiques, récoltées à Hokkaido, au Japon, en Indonésie et en Malaisie ont été soumises à ce traitement. Au moins un taxon a été isolé de chaque tige saine stérilisée en surface de chaque plante examinée, ce qui indique que plus d'un micro-organisme vivent ensemble à l'intérieur d'une même plante. Au total, 1133 souches de champignons endophytes et 678 souches de bactéries ont été isolées et sont conservées à -80°C. Ces isolats ont été criblés pour des produits utiles. De nombreuses souches de champignons et de bactéries endophytes ont produit des enzymes extracellulaires utiles qui dégradent le xylane et le mannane, constituants communs des cellules végétales, en xylo-oligosaccharides et manno-oligosaccharides. Environ 10 à 30 % des endophytes ont montré des activités antifongiques ou antibactériennes dans leurs surnageants. Certaines souches fongiques ont produit des substances bioactives qui ont montré une inhibition ou une promotion de la testostérone-5-a-réductase dans la prolifération des cellules du follicule pileux de souris in vitro. Certaines souches fongiques et bactériennes isolées de plantes indonésiennes produisaient également des enzymes amylolytiques et/ou de la mannanase. Ces résultats démontrent que les endophytes sont des sources potentielles pour découvrir des métabolites utiles, tels que des oligosaccharides, des antibiotiques et des enzymes. Les analyses phylogénétiques de l'ADNr 18S amplifié et de la région ITS incluant l'ADNr 5.8S de 25 champignons endophytes sélectionnés ont indiqué qu'ils appartenaient à divers genres. Certains champignons endophytes isolés d'arbres individuels dans le jardin botanique et autour du campus de l'université d'Hokkaido se sont révélés être des symbiotes spécifiques d'Ulmus davidiana var. japonica.(Voir PDF)

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Les champignons du charbon (Ustilaginomycètes) de Sporobolus (Poaceae)
Nouveau nom : Jamesdicksonia tremuli Vánky (en remplacement de Melanotaenium sporoboli Thirum. & M.C. Sriniv., type sur Sporobolus tremulus, Inde). Les nouvelles combinaisons sont : Jamesdicksonia major (Har. & Pat.) Vánky (basé sur Entyloma majus, type sur Sporobolus spicatus, Tchad) J. sporoboli (HS Jackson) Vánky (basé sur Tolyposporella sporoboli, type sur Sporobolus indicus, Porto Rico) Macalpinomyces spermophorus (Berk. & MA Curtis ex de Toni) Vánky (basé sur Ustilago spermophora, type sur Eragrostis poaeoides USA) M. spinulosus (L. Ling) Vánky (basé sur Ustilago spinulosa, type sur Sporobolus paniculatus, Sierra Leone) M. sporoboli (Tracy & Earle) Vánky (basé sur Ustilago sporoboli, type sur Sporobolus junceus, États-Unis) Ustilago peruviana (Zundel) Vánky (basé sur Sphacelotheca peruviana, type sur Sporobolus virginicus, Pérou) et Ustilago utahensis (Zundelahensis) , tapez sur Sporobolus patens, USA). La plante hôte d'Ustilago schlechteri Henn. n'est pas un Sporobolus mais une espèce d'Ennéapogon. Un néotype est désigné pour Ustilago schlechteri. (Voir PDF)

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D'autres nouveaux champignons du charbon (Ustilaginomycètes) d'Australie
Neuf nouvelles espèces de champignons du charbon, appartenant à huit genres, sont décrites en Australie : Dermatosorus schoenoplecti Vánky & R.G. Shivas, sur Schoenoplectus mucronatus, Entyloma grampiansis Vánky & R.G. Shivas, sur Hydrocotyle laxiflora, Macalpinomyces brachiariae Vánky, C. Vánky & R.G. Shivas, sur Brachiaria holosericea, M. digitariae Vánky & R.G. Shivas, sur Digitaria gibbosa, Restiosporium baloskionis Vánky & R.G. Shivas, sur Baloskion tetraphyllum, Thecaphora maireanae R.G. Shivas & Vánky, sur Maireana pentagona, Tilletia cape-yorkensis Vánky & R.G. Shivas, sur Whiteochloa airoides, Urocystis chorizandrae J. Cunnington, R.G. Shivas & Vánky, sur Chorizandra enodis, et Ustanciosporium tenellum R.G. Shivas & Vánky, sur Cyperus tenellus. Les nouvelles combinaisons sont : Macalpinomyces ordensis (R.G. Shivas & Vánky) Vánky & R.G. Shivas (basé sur Sporisorium ordense, type sur Brachiaria pubigera, Australie) et Sporisorium setariae (McAlpine) Vánky & R.G. Shivas (basé sur Sorosporium setariae, type sur Setaria glauca, Australie). (Voir PDF)

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Paracryptophiale pirozynskii sp. nov., un hyphomycète non décrit
Paracryptophiale pirozynskii sp. nov., présent sur des branches mortes d'arbres non identifiés, récoltés en Chine tropicale, est décrit et illustré. (Voir PDF)


Production d'enzymes de décomposition du bois, perte de masse et solubilisation de la lignine dans le bois par les ascomycètes marins et leurs anamorphes
Une étude a été menée pour établir la capacité de décomposition du bois pour un grand nombre d'ascomycètes marins divers et leurs anamorphes. La production in vitro de cellulase et de xylanase était répandue parmi 47 champignons. La production d'enzymes impliquées dans la dégradation de la lignine était comparativement moins courante. La plupart des isolats étaient capables de provoquer une perte de masse dans un substrat de bois de bouleau, bien que les valeurs aient été faibles (<5%) au cours d'une période de 24 semaines. Quelques ascomycètes ont causé une perte de masse plus élevée allant jusqu'à 20,1 %. Dans tous les cas, la pourriture du bois était plus importante dans des conditions exposées que submergées. Il a été démontré que Ascocratera manglicola, Astrosphaeriella striatispora, Cryptovalsa halosarceicola, Linocarpon bipolaris et Rhizophila marina solubilisent des quantités importantes de lignine, avec des indices de solubilisation de la lignine comparables à ceux des basidiomycètes terrestres à pourriture blanche. Certains ascomycètes marins peuvent donc remplir un rôle écologique équivalent. (Voir PDF)

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Utilisation des espèces de Macrochampignons en Malaisie
Les propriétés nutritionnelles et médicinales de nombreux macrochampignons sont bien connues et documentées en Europe, en Chine et au Japon. Cependant, ces informations sont rares et mal connues en Malaisie.Cette pénurie d'informations est probablement due à l'absence d'une "culture du champignon" traditionnelle en Malaisie ainsi qu'à une pénurie de mycologues/taxonomistes fongiques qualifiés. Champignons cultivés, par ex. pleurotes (Pleurotus spp.), shiitake (Lentinula edodes), champignon de l'oreille de Juif (appelé localement champignon de l'oreille de singe) (Auricularia spp.) et champignon de paille (Volvariella volvacea) ont longtemps été utilisés en Malaisie pour la nourriture par les Malais, les Chinois et indiens. Cependant, parmi certaines communautés locales et de nombreuses communautés autochtones (aborigènes), les espèces de macrochampignons locaux sont utilisées non seulement pour l'alimentation, mais aussi comme médicament et à des fins spirituelles, notamment pour décourager certains comportements indésirables chez les enfants. Nos observations indiquent que certaines espèces d'Auricularia, Cookeina, Cyathus, Favolus, Lentinus, Pleurocybella, Schizophyllum et Termitomyces sont consommées comme nourriture. Les espèces de Lignosus, Pycnoporus, Lentinus et Daldinia sont utilisées pour traiter diverses affections ou problèmes de santé. Une espèce d'Amauroderma est utilisée pour prévenir les crises tandis qu'une espèce de Xylaria est utilisée pour arrêter l'énurésie nocturne chez les enfants. (Voir PDF)

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Le son de riz comme substrat efficace pour la production de laccase à partir de la souche RC3 de basidiomycète thermotolérant Coriolus versicolor
Des substrats appropriés pour la production de laccase par le basidiomycète thermotolérant Coriolus versicolor souche RC3 ont été criblés en utilisant des milieux solides et liquides. Dans un milieu de base liquide, 1 % (p/v) de son de riz comme source de carbone s'est avéré être le substrat le plus efficace pour la production de laccase par rapport à 1 % (p/v) de glucose, de son de blé et de farine de paille de riz. Après 15 jours de culture à 37°C dans une culture en flacon agité, l'activité laccase extracellulaire s'est avérée être de 0,22 U/ml avec le son de riz, tandis que 0,09, 0,01 et 0,01 U/ml ont été obtenus à partir de son de blé, de glucose et de farine de paille de riz, respectivement. La concentration optimale de son de riz était de 1 % (p/v). La comparaison de la production de laccase sur trois substrats solides sélectionnés différents, y compris la farine de bois d'hévéa (Heavea sp.), la farine de bois Hang nok yoong (Delonix regia) et le son de riz, a été réalisée en utilisant 5 g de substrat solide additionné de 15 ml d'eau distillée et cultivée à 37°C dans l'obscurité pendant 30 jours. La production de laccase à partir de la souche RC3 de C. versicolor était de 1,98, 0,06 et 0,07 U/g de substrat à partir de son de riz, de farine de bois d'hévéa et de farine de bois Hang nok yoong, respectivement. La productivité de laccase la plus élevée avec le son de riz en milieu liquide était de 22 U/g de substrat à 15 jours de culture. Ceci était 11 fois plus élevé que l'activité maximale obtenue à 30 jours sur une culture sur substrat solide. (Voir PDF)

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Agaricales des îles Hawaï. 8. Agaricaceae : Coprinus et Podaxis Psathyrellaceae : Coprinopsis, Coprinellus et Parasola
Vingt-neuf espèces appartenant aux genres Coprinus et Podaxis (Agaricaceae) et Coprinopsis, Coprinellus et Parasola (Psathyrellaceae) sont signalées dans les îles Hawaï. Ces espèces représentent un assemblage polyphylétique de taxons saprotrophes à spores sombres comprenant le genre traditionnel Coprinus et le genre Podaxis qui est considéré comme un allié sécotioïde de Coprinus. Les collections ont été obtenues à partir d'une variété d'habitats allant des sols sablonneux aux tas de copeaux de bois, aux pelouses et aux pâturages, aux excréments d'ongulés, aux débris herbacés et aux troncs tombés dans les forêts mésiques exotiques et indigènes. Coprinopsis urticicola var. hawaiiensis est décrit comme nouveau, Coprinus candidolanatus est transféré à Coprinopsis, et deux espèces supplémentaires sont provisoirement décrites dans Coprinopsis. Plusieurs spécimens représentant le complexe Coprinus cordisporus ont été analysés à l'aide d'ensembles de données morphologiques et de séquences ITS pour étudier les relations au sein du groupe. Tous les taxons sont décrits, illustrés et comparés à des taxons phénétiquement similaires. Une clé dichotomique artificielle pour aider à déterminer les espèces de coprinoïdes hawaïens est présentée. (Voir PDF)

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Effet nématicide des cultures fongiques d'eau douce contre le nématode du pin, Bursaphelenchus xylophilus
Vingt-deux filtrats et 13 extraits hydrosolubles de mycéliums fongiques brisés provenant de 130 cultures fongiques d'eau douce se sont révélés pathogènes pour le nématode du pin, Bursaphelenchus xylophilus après une exposition de 48 heures par dépistage in vitro. La mobilité de plus de 90 % des nématodes était inhibée par les filtrats de la commune Ophioceras (97,18 %), Pseudohalonectria adversaria (96,49 %), Pseudohalonectria lignicola (96,15 %), Massarina thalassioidea (93,2 %), Caryospora callicarpa (95,2 %) et Annulatascus sp . (96,12 %) et les extraits de mycélium d'Helicomyces roseus (98,95 %), de Phomatospora berkeleyi (94,96 %) et de Pseudohalonectria lignicola (95,59 %). Des extraits aliphatiques de quatre produits de fermentation à l'état solide fongiques d'eau douce ont immobilisé plus de 50 % des nématodes au cours d'une période d'exposition de 12 heures à une concentration de 40 mg/mL. Il a également été observé que les extraits aliphatiques de Pseudohalonectria adversaria, Xylaria sp. et Hyphomycete sp. étaient nématicides, alors que Massarina bipolaris, Caryospora callicarpa et une souche non identifiée se sont révélés être de nature narcotique parce que les nématodes ont repris vie lorsqu'ils ont été transférés dans de l'eau stérilisée. Lors du dépistage des activités nématicides, il est important d'utiliser des environnements neutres et salins approximatifs similaires aux habitats naturels des nématodes testés, car les nématodes peuvent être affectés par un pH extrême et une pression osmotique élevée. (Voir PDF)

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Identification et pathogénicité des espèces Graphium et Pesotum à partir de blessures par machette sur Schizolobium parahybum en Equateur
Schizolobium parahybum est originaire d'Équateur et est largement répandu dans toute l'Amérique du Sud. Cet arbre a des propriétés de bois idéales et est une espèce privilégiée pour le développement des plantations. Les arbres de Schizolobium parahybum, cependant, souffrent d'une maladie grave qui cause des pertes substantielles aux plantations en Equateur. La plupart des arbres malades ont été régulièrement blessés avec des machettes et il a été suggéré que ces blessures pourraient fournir des portes d'entrée pour les agents pathogènes. Pour déterminer le rôle possible que les champignons associés aux blessures par machette pourraient jouer dans le développement de la maladie, des échantillons de bois ont été prélevés sur ces blessures et examinés pour détecter d'éventuels agents pathogènes. Un certain nombre d'agents pathogènes potentiels ont été identifiés, notamment Ceratocystis fimbriata, C. moniliformis, Graphium spp. et Pesotum spp. L'objectif de cette étude était d'identifier les vingt et un hyphomycètes synnémateux, à partir de plaies sur S. parahybum, en utilisant les données de séquence de la petite sous-unité (SSU) et de l'espaceur transcrit interne (ITS) de l'opéron d'ARN ribosomique. Nous avons également étudié le rôle possible de ces espèces dans le développement de la maladie dans une piste d'inoculation en serre. Les résultats ont montré que quinze isolats résident dans le complexe Graphium penicillioides (Ordre : Microascales). Quatre isolats résidaient dans les Ophiostomatales et représentent l'anamorphe Pesotum d'Ophiostoma quercus. Les deux isolats restants étaient des anamorphes Pesotum non identifiés d'Ophiostoma. Aucune des trois espèces n'a produit de lésions significatives dans une piste d'inoculation en serre et nous ne les considérons pas comme des agents pathogènes de S. parahybum. (Voir PDF)

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Diversité morphologique des hyphopores des Gomphillacées (Ostroples, Ascomycètes lichénisés)
Les hyphophores sont des structures productrices de conidies hautement spécialisées caractéristiques des Gomphillacées. Dans cet article, la grande diversité et variabilité de ces structures est évaluée. De nouveaux hyphophores sétiformes d'espèces non identifiées des genres Calenia, Echinoplaca et Tricharia sont décrits. Un nouveau regroupement est proposé, basé sur la morphologie externe et l'ontogénie possible de ces conidiomes. (Voir PDF)

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Un nouveau type de pore septal conidien chez les champignons
Un nouveau type de pore septal conidien est illustré pour la première fois en microscopie électronique à transmission. Au microscope optique, les conidies de toutes les espèces de Canalisporium et certaines espèces d'Acrodictys et de Cancellidium possèdent des eupta épais avec des épaississements en forme de tonneau brun foncé incrustés dans les cloisons entourant les pores septaux. Des pores similaires se trouvent dans les conidies distosepta chez certaines espèces d'Ellisembiai. Ces épaississements en forme de tonneau ressemblent superficiellement aux septa dolipores des basidiomycètes. Les épaississements en forme de tonneau d'espèces sélectionnées ont été examinés au niveau de la microscopie électronique à transmission et ces épaississements se sont révélés être composés de matériaux denses aux électrons déposés dans la couche de la paroi septale. Le centre des épaississements est creux formant des pores septaux.
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Champignons thermotolérants pourrissant le bois isolés du nord de la Thaïlande et leurs utilisations potentielles dans les applications de dégradation de la lignine
Cent treize taxons pourris du bois ont été isolés du nord de la Thaïlande. L'isolat C. versicolor RC3 a présenté une croissance très active à 37ºC parmi 10 isolats thermotolérants comprenant des souches ST40, TP7, TP16, NP14, NP18, NP21, NP26, NP27, 7M et C. versicolor souche RC3. L'isolat RC3 s'est avéré être du Coriolus versicolor qui a dégradé le colorant Poly R-478 à 42°C. Des études comparatives de croissance sur gélose pomme de terre dextrose ont révélé que la souche RC3 de C. versicolor avait presque le même taux de croissance que la souche ATCC 34541 de Phanerochaete chrysosporium à 37 et 42°C, contrairement à C. versicolor IFO30388. Lorsqu'elle est cultivée dans le milieu de base liquide contenant 0,02 % de colorant Poly R-478 à 37°C avec agitation à 150 tr/min, la souche RC3 de C. versicolor a complètement dégradé le colorant Poly R-478 en 5 jours. Ceci est plus actif que le champignon de la pourriture blanche qui dégrade la lignine, P. chrysosporium. L'ajout de 1 % (p/v) de glucose et de 0,2 % (p/v) de NH4NO3 au milieu a amélioré la dégradation du colorant. La souche RC3 de Coriolus versicolor a éliminé la couleur brune des copeaux de bois d'hévéa, ce qui a fait passer la luminosité de 37,05 à 46,07 de la valeur L* sans nutriments. Cet effet n'a pas été trouvé dans un état riche en nutriments. (Voir PDF)

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Variation temporelle des assemblages d'endophytes des feuilles de Plumeria rubra
Le schéma temporel de l'infection endophyte dans les feuilles de Plumeria rubra, un arbre tropical à feuilles caduques, a été étudié en échantillonnant les feuilles d'un arbre individuel pendant une période d'un an. Les endophytes ont pu être isolés des feuilles tout au long de la période d'étude. Les feuilles plus âgées étaient plus densément colonisées que les feuilles plus jeunes. Les hyphomycètes dominaient l'assemblage endophyte des feuilles les plus jeunes, tandis que les feuilles les plus âgées abritaient davantage de coelomycètes. Cette étude indique qu'il existe une variation temporelle des assemblages d'endophytes dans les feuilles de certaines plantes hôtes tropicales.
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Biodiversité des champignons sur bois submergé dans un ruisseau et estuaire dans la baie de Tai Ho, Hong Kong
Du bois en décomposition a été collecté dans un ruisseau et un estuaire de la baie de Tai Ho et a été étudié pour la biodiversité des champignons saprobiques. Cinquante-cinq taxons, dont 33 ascomycètes et 22 champignons anamorphiques ont été recensés. Les taxons communs étaient Aniptodera chesapeakensis, Ascosalsum unicaudata, Lignincola laevis, Lophiostoma bipolare et Neptunella longirostris. La composition en espèces fongiques différait grandement entre les deux sites : le ruisseau d'eau douce qui se jetait dans la mer et l'autre, une région estuarienne située à l'embouchure du ruisseau qui incorporait une végétation de mangrove. La biodiversité des champignons d'eau douce et des champignons de mangrove de ces sites est comparée aux études précédentes. Taxons intéressants, à savoir Aniptodera haispora, Ascosalsum unicaudata, Nemania cf. maritima et Pseudohalonectria longirostrum sont discutés et illustrés. (Voir PDF)

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Les champignons du charbon (Ustilaginomycètes) de Bothriochloa, Capillipedium et Dichanthium (Poaceae)
Deux NOUVELLES ESPÈCES proposées sont : Sporisorium dichanthii Vánky & N.D. Sharma (type sur Dichanthium aristatum, Inde), et S. rubyanum Vánky & N.D. Sharma (type sur Capillipedium assimile, Inde). Huit NOUVELLES COMBINAISONS sont : Macalpinomyces Bothriochloae (L. Ling) Vánky (basé sur Ustilago Bothriochloae, type sur Bothriochloa pertusa, Chine) Sporisorium bothriochloae (L. Ling) Vánky (basé sur Sorosporium Bothriochloae, type sur Bothriochloa glaorium, Malawi) Mundkur & Thirum.) Vánky (basé sur Sphacelotheca dichanthicola, type sur Dichanthium caricosum, Inde) Sporisorium dinteri (H. & P. Sydow) Vánky (basé sur Ustilago dinteri, type Andropogon papillosus, Namibie) Sporisorium (Z.B. reticula) Li & Du) Vánky (basé sur Sphacelotheca reticulata, type Bothriochloa ischaemum, Chine) Sporisorium sahayai (Mundkur) Vánky (basé sur Sphacelotheca sahayai, type sur Dichanthium annulatum, Inde) Sporisorium sahayai (Mundkur) Vánky (basé sur Sphacelotheca sahayai, type sur Dichanthium annulatum, Inde) Sporisorium superfluum. (H.) & V. & Ustilago superflua, type Andropogon foveolatus, Inde), et Sporisorium tenue (H. & P. Sydow) Vánky (basé sur Ustilago tenuis, type Andropogon pertusus, I Inde). Les treize noms suivants sont considérés comme des SYNONYMES : Sphacelotheca chloridis Mundkur (type sur Bothriochloa pertusa, Inde), Ustilago bothriochloae-intermediae Padwick (type sur Bothriochloa intermedia, Inde) et Sorosporium baluchistani Ahmad (type sur Bothriochloa sp., Pakistan) sont des Sporisorium andropogonis (Opiz) Vánky (type sur Dichanthium ischaemum, Rép. tchèque) Schroeteria annulata Ellis & Everh., Ustilago duthiei Ricker, Ustilago amphilophidis Zundel, et Ustilago sabourieana Mishra (tous sur Dichanthium annulatum. ) RS Wang & M. Piepenbr. (type sur Dichanthium annulatum, Inde) Sorosporium andropogonis-micranthi Y. Ling & T.L. Chen (type sur Capillipedium parviflorum, Chine), Sphacelotheca capillipedii L. Ling (type sur Capillipedium parviflorum Chine), et Sphacelotheca pakistanica S. Ahmad (type sur Capillipedium parviflorum, Pakistan) sont des synonymes de Sporisorium doidgeae (Zundel) Langdon & Fullerton ( sur Bothriochloa bladhii, Afrique du Sud) Sphacelotheca amphilophis H. Sydow (type sur Bothriochloa insculpta, Afrique du Sud), Sphacelotheca bothriochloae Zundel (type sur Bothriochloa decipiens, Australie), et Sphacelotheca macalpinae Zundel (type sur Bothriochloa bladhii) représentent H. & P. Sydow) Vánky (type sur Bothriochloa pertusa Inde). Une liste hôte-parasite et une clé facilitent l'identification des 19 espèces de champignons du charbon désormais reconnues sur les genres de graminées Bothriochloa, Capillipedium et Dichanthium. (Voir PDF)

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Pestalotiopsis kunmingensis sp. nov., un endophyte de Podocarpus macrophyllus
Une étude sur la diversité fongique des espèces de Pestalotiopsis présentes sur les Podocarpaceae a révélé une espèce inconnue, décrite ici sous le nom de Pestalotiopsis kunmingensis. Cette espèce qui se présente comme un endophyte, a été isolée de Podocarpus macrophyllus. Il partage des caractères morphologiques similaires à d'autres espèces de Pestalotiopsis, mais possède de longs appendices apicaux qui sont noueux (spathulés) à l'extrémité, un seul appendice basal ramifié et des cellules médianes versicolores. (Voir PDF)

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Pseudolachnella vermospora sp. nov. de Yuchania vigens en Chine
Cet article décrit et illustre Pseudolachnella vermospora sp. nov., à partir de tiges vivantes de Yushania vigens, et le nouveau taxon est comparé à des espèces similaires. Un synopsis et des diagrammes de toutes les espèces acceptées de Pseudolachnella sont fournis.
(Voir PDF)

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Ophiostoma et Ceratocystiopsis spp. associé à deux scolytes infestant le pin au Chili
Les scolytes (Coleoptera : Scolytidae) sont des vecteurs courants d'Ophiostoma spp., qui comprennent des agents pathogènes primaires des arbres ainsi que d'importants agents de coloration de l'aubier. Au Chili, Hylurgus ligniperda et Hylastes ater, qui sont originaires d'Europe, se rencontrent couramment sur l'exotique Pinus radiata. Peu de recherches ont été faites sur Ophiostoma spp. associés aux scolytes au Chili et en particulier ceux véhiculés par des insectes introduits infestant le pin. Nous avons récemment collecté des spécimens de ces scolytes et de leurs galeries, et le but de cette étude était d'isoler et d'identifier Ophiostoma spp. associé aux deux espèces de scolytes. L'identification a été réalisée à l'aide des caractéristiques morphologiques et, le cas échéant, du séquençage de l'ADN. Au total, cinq champignons ophiostomatoïdes (Ceratocystiopsis minuta, Ophiostoma galeiformis, O. huntingii, O. ips et O. quercus) ont été trouvés associés aux scolytes, tous signalés au Chili pour la première fois. (Voir PDF)



Variation inattendue de la séquence d'espacement transcrite interne de l'ADN ribosomique au sein d'Erysiphe aquilegiae sensu lato
Erysiphe aquilegiae sensu lato est le champignon de l'oïdium (Erysiphales : Ascomycota) le plus répandu sur les Ranunculaceae. Sur la base de caractères morphologiques, différents auteurs ont proposé la ségrégation d'Erysiphe aquilegiae en deux variétés ou espèces. Pour déterminer s'il existe une base génétique pour ces deux taxons, les régions d'espacement interne transcrites de l'ADNr de 26 spécimens de cinq genres hôtes ont été comparées par RFLP et séquençage. Les résultats n'ont pas réussi à séparer les deux taxons, mais ont révélé un troisième taxon spécialisé dans l'hôte sur Delphinium. L'analyse phylogénétique a révélé que E. aquilegiae était plus étroitement lié à Oidium lycopersici et E. macleayae qu'aux espèces non décrites sur Delphinium (Voir PDF)

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Champignons zoosporiques aquatiques issus de spores appâtées de cryptogames
Des champignons zoosporiques sur des appâts de spores de 24 taxons de cryptogames provenant de trois plans d'eau ont été étudiés. Au total, 61 taxons de champignons zoosporiques ont été notés, avec une prédominance des espèces Chytridiales (27) et Peronosporales (14). Le plus grand nombre d'espèces (46) a été enregistré dans les eaux stagnantes de l'étang de Dojlidy, avec moins (31) de la rivière Suprasl et 34 espèces de la source Jaroszówka. Cinq espèces de Pythium ont été signalées pour la première fois en Pologne. (Voir PDF)

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Lactarius (Russulaceae) à Kumaon Himalaya.
1. Nouvelles espèces du sous-genre Russularia
Trois nouvelles espèces de Lactarius (L. sanjappae, L. mukteswaricus et L. verbekenae) sont décrites à partir de collections réalisées en Inde. Des illustrations de leurs caractéristiques macro- et microscopiques et des données sur leur distribution écologique sont présentées. (Voir PDF)

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Evaluation de microchampignons pour la lutte biologique contre la jacinthe d'eau en Egypte
Vingt-deux espèces fongiques ont été isolées à partir de parties de jacinthe d'eau stérilisées en surface présentant un syndrome de brûlure prononcé. Les espèces les plus communes étaient Alternaria alternata, Drechslera hawaiiensis et Ulocladium atrum. Les modèles d'abondance fongique ont été influencés positivement par les changements de conductivité (CE) et négativement par le pH et la température (TE). À la suite d'un test de pathogénicité, et sur la base de la gravité de la maladie, les espèces pathogènes ont été divisées en espèces légèrement, faiblement modérément, élevée modérément et gravement dommageables. Parmi ces espèces, seul Al. alternata (associé à 79 % de mortalité tissulaire), D. hawaiiensis (78 %) et U. atrum (70 %) ont montré une sévérité élevée de la maladie. Parce qu'Al. alternata, a été signalée comme une espèce plurivore avec plusieurs pathotypes, D. hawaiiensis et U. atrum ont été sélectionnés pour une étude plus approfondie. La formulation et la pulvérisation quotidienne d'eau ont permis la germination et l'infection des conidies par ces espèces au champ. Les deux traitements ont donné des résultats similaires. L'incidence de la maladie (DI) et la gravité de la maladie (DS) ont augmenté avec l'augmentation de la période d'incubation jusqu'à 30 jours d'incubation.Simultanément, la teneur en chlorophylle a diminué dans les feuilles infectées par rapport aux feuilles saines. Le DI et le DS ont tous deux diminué après 30 jours d'incubation, ce qui indique qu'il n'est pas efficace d'utiliser D. hawaiiensis et U. atrum soit séparément soit dans une formulation mixte comme agents de lutte biologique. (Voir PDF)

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Variation génétique d'Alternaria alternata, un champignon endophyte isolé de Pinus tabulaeformis tel que déterminé par des microsatellites amplifiés aléatoirement (RAMS)
La variation génétique de 112 isolats d'Alternaria alternata, un champignon endophyte isolé de Pinus tabulaeformis, a été réalisée à l'aide de deux amorces RAMS (CCA et CGA). Les 1273 bandes produites étaient claires et reproductibles et allaient de 200 à 2000 paires de bases. L'analyse des deux amorces a révélé un niveau élevé de diversité génétique (H' = 2,79) parmi les 112 isolats testés. Au total, 20 marqueurs ont été notés. Deux marqueurs étaient présents dans tous les isolats, tandis que les 18 autres (90 %) marqueurs étaient présents dans des combinaisons de 105 (93,8%) génotypes différents parmi les 112 isolats. Les coefficients de similarité génétique entre les isolats par paires variaient de 0,3 à 1 sur la base d'une méthode de groupe apparié non pondérée d'analyse de grappes de moyenne arithmétique (UPGMA). Il n'y avait aucune relation entre les génotypes fongiques et l'âge des tissus de l'hôte, et le champignon endophyte A. alternata semble avoir le potentiel d'évoluer relativement rapidement et de maintenir une variation génétique significative. (Voir PDF)

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Spores fongiques dans l'eau de pluie : assemblages de conidies d'écoulement de tige, de chute et de gouttière
L'eau de pluie provenant d'arbres vivants et d'une gouttière a été collectée en Hongrie de juin 2002 à janvier 2003 et analysée pour les spores fongiques. Le nombre total d'espèces était de 71. Des conidies de 63 espèces ont été identifiées dans des échantillons d'écoulement de tige et de chute prélevés sur 13 arbres. La majorité des espèces étaient hyphomycètes et 3 espèces appartenaient à des anamorphes coelomycètes. Le nombre d'espèces par arbre variait de 5 à 25. La plupart des espèces ont été trouvées dans un échantillon d'égout prélevé sur Taxus baccata en octobre. Une sporulation in situ de certaines espèces corticoles et foliicoles a été observée. Des conidies de 25 espèces ont été détectées dans l'eau de pluie d'un caniveau. La majorité définitive des spores, provenant à la fois d'arbres et d'une gouttière, appartenaient aux espèces principalement connues sous le nom de litière terrestre habitant des champignons. Camposporium pellucidum, Diplocladiella scalaroides, Lateriramulosa uni-inflata, Trinacrium spp. et Tripospermum myrti, considérées comme des espèces rares dans les cours d'eau, étaient largement distribuées dans les eaux de pluie provenant d'arbres vivants en milieu urbain. Les espèces et le nombre de conidies des hyphomycètes aquatiques communs dans l'eau de pluie provenant des arbres ou d'une gouttière étaient faibles. L'exception était Tetracladium marchalianum dont le nombre de conidies dans l'eau de pluie dans une gouttière était beaucoup plus élevé qu'il n'a jamais été observé dans les habitats de cours d'eau. (Voir PDF)

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Ultrastructure des asques et ascospores de Torrentispora fibrosa
L'apex de l'asque et les ascospores de Torrentispora fibrosa sont illustrés au niveau de l'ultrastructure. Torrentispora fibrosa est typique des Annulatascaceae en ce qu'elle a des asques avec une paroi bilamellée et un anneau apical bipartite avec un bouchon. Les ascospores diffèrent des espèces des autres genres de la famille en ce qu'elles sont épaisses et dépourvues d'ornements muraux verruqueux. (Voir PDF)

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Champignons d'eau douce dans le lac Dianchi, un lac fortement pollué du Yunnan, en Chine
Des champignons d'eau douce sur des substrats ligneux et des herbes submergés ont été étudiés dans le lac Dianchi, un lac très pollué de Kunming, dans la province du Yunnan, en Chine. Cent substrats ligneux submergés ont été collectés dans ce lac tous les trois mois et examinés pour rechercher des champignons afin d'étudier les variations saisonnières. Au total, 97 champignons ont été recensés, dont 56 ascomycètes et 41 champignons anamorphiques. L'occurrence de ces champignons a été enregistrée et l'indice de Shannon-Weiner (H´) a été utilisé pour évaluer la diversité fongique. Les résultats ont montré que la variation entre les quatre collections saisonnières était insignifiante. Les indices de diversité (H´) des collectes des quatre saisons variaient de 3,155 à 3,681. La communauté fongique sur les substrats ligneux du lac Dianchi est comparée à celle du lac Fuxian au cours de la même saison et des différences étaient apparentes (indice de similitude = 0,337). La diversité était plus élevée dans le lac Fuxian (H´ = 3,808) que dans le lac Dianchi (H´ = 3,368) et cela peut être lié à la végétation riveraine et à la pollution. Les effets de la pollution sur les communautés fongiques d'eau douce sont discutés. Cent échantillons immergés de chacune des trois espèces monocotylédones (Phragmites australis, Pennisetum purpurreum et une espèce de bambou) ont été collectés dans le lac Dianchi et examinés pour rechercher des champignons. Les communautés de chaque espèce de graminées sont comparées et discutées en fonction de la spécificité de l'hôte. (Voir PDF)

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Nouvelles espèces et rapports sur le système d'accouplement chez Gymnopus (Agaricales) du Costa Rica
Trois nouvelles espèces de Gymnopus sont décrites à partir de matériel collecté récemment au Costa Rica. Gymnopus cylindricus et G. alnicolus sont placés dans la sect. Vestipèdes. Un autocroisement de la nouvelle morpho-espèce G. pseudolodgeae a révélé un système d'accouplement unifactoriel. Le même résultat a été obtenu chez les espèces apparentées G. lodgeae et G. omphalodes. Gymnopus omphalodes est proposé comme une nouvelle combinaison. Une seule espèce biologique est signalée pour G. omphalodes dans le centre et le sud du Costa Rica. (Voir PDF)

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Certains endophytes de Musa acuminata sont-ils des agents pathogènes latents ?
Des champignons isolés en tant qu'endophytes du bananier sauvage (Musa acuminata) ont été testés afin de déterminer s'ils sont capables de provoquer des symptômes de maladie sur des feuilles de bananier saines. Les endophytes Cladosporium musae, Colletotrichum gloeosporioides, Cordana musae, Deightoniella torulosa, Guignardia cocoicola, Periconiella musae et Pestalotiopsis sp. ont été inoculés sur des feuilles de bananier in vitro pour tester leur pathogénicité. Seule Deightoniella torulosa a pu provoquer des taches foliaires sur des feuilles de bananier in vitro. Ce résultat confirme des rapports antérieurs selon lesquels les agents pathogènes fongiques peuvent être latents chez leur hôte bien avant l'apparition des symptômes de la maladie. (Voir PDF)

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Premiers enregistrements de protostélides du nord de l'Inde
Douze espèces de protostélides ont été isolées à partir d'échantillons de déchets aériens et terrestres collectés sur trois sites d'étude dans les montagnes himalayennes du nord de l'Inde. Des échantillons de déchets aériens ont donné sept espèces et neuf espèces ont été récupérées à partir d'échantillons de déchets au sol. Quatre espèces ont été enregistrées dans les deux types de litière. Schizoplasmodiopsis pseudoendospora était l'espèce la plus largement distribuée et a été enregistrée dans les deux types de litière et sur les trois sites d'étude. (Voir PDF)

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Deux nouvelles espèces d'Ustilaginomycètes sur Chrysopogon fallax d'Australie
Sporisorium fallax sp. nov. (Ustilaginaceae, Ustilaginomycetes) est décrite et illustrée à partir d'inflorescences de Chrysopogon fallax récoltées dans le Territoire du Nord, Australie. Les séquences de l'espaceur interne transcrit de l'ADN ribosomique ont confirmé que S. fallax était distinct de deux espèces morphologiquement similaires, S. tumefaciens et S. tumiforme, sur C. fallax. Macalpinomyces tubiformis sp. nov. (Ustilaginaceae, Ustilaginomycetes) est décrite et illustrée à partir d'ovaires de Chrysopogon fallax collectés dans le Queensland, en Australie. (Voir PDF)

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Quelques espèces intéressantes d'Asterina du Guangdong, Chine
Cinq espèces du genre Asterina de la province du Guangdong (Chine) sont décrites dans cet article. Parmi elles, Asterina elaeocarpicola, A. garciniae et A. nodosa sont nouvelles en Chine, et Asterina tetracericola est décrite et illustrée comme une nouvelle espèce. (Voir PDF)

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Les champignons du charbon (Ustilaginomycètes) des Boutelouinae (Poaceae)
Quatorze espèces de champignons du charbon sont reconnues dans la sous-tribu des graminées Boutelouinae. Des descriptions détaillées et des synonymes avec les auteurs et le lieu de publication sont donnés pour toutes les espèces reconnues. Chaque espèce est illustrée par des dessins au trait de l'habitude et dans de nombreux cas également de sores agrandis, ainsi que par des images LM et SEM des spores. Nouvelle espèce décrite : Ustilago subminor Vánky. Les trois noms suivants sont considérés comme de nouveaux synonymes de Macalpinomyces spermophorus : Ustilago boutelouae Kellerman & Swingle, U. convertere-sexualis Durán et U. pueblaensis Durán. Sept autres synonymies, établies par différents auteurs, sont confirmées. Des lectotypes sont désignés pour Ustilago boutelouae-humilis Bref., U. hieronymi Schröter (= U. buchloës Ellis & Tracy), U. calcara Griffiths et U. hilariae Ellis & Tracy (= U. vilfae G. Winter). Une clé de l'espèce et une liste d'hôtes-parasites sont fournies pour faciliter l'identification des champignons du charbon de Boutelouinae. (Voir PDF)

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Les champignons du charbon (Ustilaginomycètes) de Muhlenbergia (Poaceae)
Seize espèces de champignons du charbon sont reconnues sur le genre de graminées Muhlenbergia. Des descriptions détaillées et des synonymes avec les auteurs et le lieu de publication sont donnés pour toutes les espèces reconnues. Chaque espèce est illustrée par des dessins au trait du port et par des images LM et SEM des spores. Le nom Ustilago muhlenbergiae Henn. var. tucumanensis Hirschh. [U. tucumanensis (Hirschh.) Zundel] est considéré comme synonyme de U. mexicana Ellis & Earle. Cinq autres synonymies, établies par G.W. Fischer, sont confirmés. Une clé de l'espèce et une liste d'hôtes-parasites sont fournies pour faciliter l'identification des champignons du charbon de Muhlenbergia. (Voir PDF)

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Une nouvelle espèce du genre Pseudocathrus du Yunnan, Chine
Pseudoclathrus yunnanensis sp. nov. trouvé au sol dans la forêt de Xiaobailong dans la banlieue de Kunming, dans la province du Yunnan, en Chine, est décrit, illustré et comparé à des taxons similaires. Une clé des espèces de Pseudocathrus est fournie. (Voir PDF)


Les hyphomycètes marins de Thaïlande et Cumulospora varia sp. nov.
Les hyphomycètes marins collectés en Thaïlande sont répertoriés et discutés, avec la description d'une nouvelle espèce, Cumulospora varia qui a été trouvée dans plusieurs régions de Thaïlande est décrite et comparée à C. marina. (Voir PDF)

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Pyrénomycètes néotropicaux : Porosphaerella borinquensis sp. nov. et son anamorphe Pseudobotrytis terrestris
Porosphaerella borinquensis est décrite et sa connexion avec Pseudobotrytis terrestris est établie in vitro. Ses relations au niveau générique et familial sont discutées. Il est similaire à Porosphaerella cordanophora dans les morphologies ascomatale et ascosporale, bien qu'un peu plus petit. Chez les deux espèces, les anamorphes ont des loci conidiogènes ressemblant à des spinules et des conidies pigmentées, monoseptées, ellipsoïdes à oblongues. Pseudobotrytis terrestris diffère de Cordana pauciseptata par ses conidiophores disposés en ombelle. Bien que les données ne soient pas présentées ici, l'ADN ribosomique de la grande sous-unité nucléaire de P. borinquensis et de P. cordanophora confirme leurs affinités génériques. D'autres travaux ont montré que Porosphaerella semble avoir des affinités avec les Coniochaetales. (Voir PDF)

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Distribution de champignons sur bois dans la rivière Tutong, Brunei
Cinq sites le long de la rivière Tutong et de son affluent, le Sungai Kelakas, ont été échantillonnés à la recherche de champignons sur du bois en décomposition. Soixante-six taxons ont été trouvés, dont deux nouveaux genres et deux nouvelles espèces. Près de la moitié d'entre eux (48 %) sont de nouveaux records pour Brunei. Bien que les taxons communs ne soient généralement pas uniques à un site particulier, les distributions des espèces étaient corrélées au gradient de salinité. Ces résultats sont cohérents avec des études antérieures montrant que certains champignons marins sont tolérants à des conditions moins salines et que certaines espèces d'eau douce sont tolérantes à des conditions plus salines. Certaines espèces pourraient être potentiellement classées comme espèces d'eau saumâtre. Le rapport des ascomycètes aux champignons anamorphiques était plus élevé dans les sites marins que dans les sites d'eau douce. Une liste de contrôle des champignons trouvés dans les habitats aquatiques au Brunei est incluse. (Voir PDF)

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Évaluation phylogénétique de la nomenclature des espèces de Pestalotiopsis en relation avec l'association hôte
Les données d'ADN d'un certain nombre d'isolats de Pestalotiopsis ont été analysées pour déterminer si les isolats du même hôte sont liés phylogénétiquement. La validité de la désignation des espèces de Pestalotiopsis en fonction de l'association avec l'hôte a été étudiée. Les régions de l'ITS et 5,8S du gène de l'ADNr ont été amplifiées à partir de l'ADN génomique par PCR. Les caractères de l'ADN ont été analysés en utilisant des critères de parcimonie maximale (pondérée et non pondérée) et de vraisemblance maximale. Les isolats du même hôte n'étaient pas étroitement apparentés sur le plan phylogénétique. Une relation phylogénétique étroite entre les isolats possédant des caractères morphologiques similaires était apparente. Les résultats indiquent que la dénomination des espèces basée sur l'association d'hôtes est imprudente et contestent l'hypothèse selon laquelle les espèces sont spécifiques à l'hôte. Lorsque de nouvelles espèces de Pestalotiopsis sont décrites, les caractères morphologiques doivent être pris en compte plutôt que l'association d'hôtes. Les implications des résultats sur les études de biodiversité fongique sont discutées. (Voir PDF)

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Quelques hyphomycètes cercosporoïdes de Taïwan, dont une nouvelle espèce de Stenella et de nouveaux signalements de Distocercospora pachyderma et Phacellium paspali
Un hyphomycète cercosporoïde parasite d'Itea parviflora à Taïwan est décrit comme la nouvelle espèce Stenella iteae. L'hyphomycète parasite des graminées Phacellium paspali est signalé pour la première fois en Asie à partir de la nouvelle plante hôte Setaria palmifolia. Distocercospora pachyderma sur Dioscorea sp. est pour la première fois signalé pour Taïwan. De nouveaux détails sur la morphologie de ces champignons sont donnés. Pseudocercospora clematidis est transféré à Pseudocercosporella. Cinq autres espèces de champignons cercosporoïdes de nos collections à Taïwan sont répertoriées. (Voir PDF)

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Biodiversité et récurrence tissulaire des champignons endophytes chez Tripterygium wilfordii
Un total de 343 isolats fongiques endophytes représentant 60 taxons dont 30 morphotypes ont été isolés des différentes parties de la plante médicinale chinoise, Tripterygium wilfordii. Dans la plupart des cas, les souches fongiques n'ont été identifiées au genre que parce que l'identification des espèces était difficile dans ces genres spécifiques. Les isolats non sporulants ont été désignés comme Morphotypes 1 à 30. Les assemblages endophytes de T. wilfordii comprenaient un certain nombre d'espèces cosmopolites telles que Colletotrichum gloeosporioides, Guignardia sp., Glomerella cingulata, Pestalotiopsis spp., Phomopsis spp. et Phyllosticta sp. La communauté fongique globale de T. wilfordii était modérément diversifiée. La communauté fongique des parties du xylème des rameaux était la plus diversifiée, suivie des feuilles, de l'écorce des rameaux, du xylème des racines et des fleurs. Pestalotiopsis cruenta, Phomopsis sp. B et Phomopsis sp. A étaient principalement isolés du xylème des rameaux et de l'écorce. Ces endophytes n'ont pas été isolés des racines, des feuilles et des fleurs. De même, Glomerella cingulata et Guignardia sp. étaient principalement isolés dans les feuilles. Phialophora sp. n'a été isolé que dans le xylème des racines. En revanche, Pestalotiopsis disseminata a été isolé de tous les tissus à l'exception de l'écorce des racines. Morphotype sp. 1 a été isolé à partir de segments de rameaux et de racines. Il est intéressant de noter que l'écorce de racine n'abritait que Morphotype sp. 1 et aucun autre champignon endophyte n'a été isolé de l'organe. Pestalotiopsis spp. ont été fréquemment isolés comme endophytes racinaires dans cette étude. La composition des espèces et la fréquence des espèces endophytes dépendent du type de tissu. Les champignons dominants isolés à partir des différents tissus de l'hôte ont exprimé un bon degré de récurrence tissulaire.
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Diversité des hyphomycètes saprobiques sur Proteaceae et Restionaceae d'Afrique du Sud
Pour évaluer la diversité des microchampignons saprobiques présents sur les Proteaceae et les Restionaceae de la province du Cap occidental en Afrique du Sud, des échantillons de litière de feuilles, de tiges, de capitules et de chaume ont été collectés de 2000 à fin 2002. Environ 1 000 collections de champignons ont été faites, dont 117 étaient des hyphomycètes, représentant 66 espèces dans 53 genres. Parmi celles-ci, 49 espèces ont été nouvellement enregistrées en Afrique du Sud, et 64 se sont produites sur des substrats hôtes non signalés auparavant. La diversité des hyphomycètes sur Proteaceae et Restionaceae est discutée, ainsi qu'une liste des hyphomycètes. (Voir PDF)

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Champignons sauvages utiles du parc national de La Malinche, Mexique
Cette étude présente une liste de 93 espèces de champignons collectées dans le parc national de La Malinche, à Tlaxcala, au Mexique. Les champignons ont été récoltés principalement pendant les saisons des pluies de 1988-2002. Parmi les espèces identifiées, 10 étaient des Ascomycota, 82 Basidiomycota et un Myxomycota. Cette étude fournit des informations sur l'habitat, la phénologie et les formes de vie des espèces étudiées. De plus, une technique ethnobiologique connue sous le nom de liste libre a été utilisée pour identifier les espèces de champignons les plus importantes pour 84 personnes vivant sur le volcan appelé La Malinche. Boletus pinophilus est l'espèce que les répondants ont le plus souvent mentionnée. Aucune différence n'a été observée entre les mâles et les femelles en ce qui concerne les champignons qu'ils connaissaient. Il y avait cependant quelques différences dans les espèces mentionnées par les habitants de Javier Mina et de San Isidro Buensuceso, deux villes situées sur les pentes de La Malinche. (Voir PDF)

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Deux nouvelles espèces de Stachybotrys, et une clé du genre
Stachybotrys palmae sp. nov. trouvé sur des pétioles en décomposition de Licuala longicalycata dans une forêt marécageuse de tourbe, Thaïlande, et S. cordylines sp. nov. trouvés sur des feuilles en décomposition de Cordyline banksii en Nouvelle-Zélande sont décrits et illustrés. Les nouvelles espèces sont comparées aux autres espèces du genre et une clé est fournie pour toutes les espèces acceptées de Stachybotrys. Un nouveau nom, S. thermotolerans, est proposé pour S. ramosa Udaiyan, un homonyme ultérieur de S. ramosa Dorai & Vittal. Une liste des espèces de Stachybotrys acceptées avec des références est fournie. (Voir PDF)

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Nouveaux champignons du charbon (Ustilaginomycetes) du Mexique et du genre Lundquistia
Le genre Lundquistia est corrigé et élargi. Douze nouvelles espèces de champignons charbonniers sont décrites du Mexique : Lundquistia mexicana sur Andropogon gerardii et Schizachyrium mexicanum, Entyloma aldamae sur Aldama dentata, E. siegesbeckiae sur Siegesbeckia orientalis, Jamesdicksonia festucae sur Festuca toluculacel , S. ustilaginiforme sur Muhlenbergia pulcherrima, Tilletia brefeldii sur Muhlenbergia filiculmis, T. gigacellularis sur Bouteloua filiformis, T. microtuberculata sur Muhlenbergia pulcherrima, Ustilago circumdata sur Muhlenbergia montana, et U. panici-virgati sur Panicum virgatum. Nouvelles combinaisons proposées : Lundquistia dieteliana, L. duranii et L. panici-leucophaei, avec ses trois nouveaux synonymes, Ustilago bonariensis, Sorosporium lindmanii et L. fascicularis. (Voir PDF)

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Pyrénomycètes du parc national des Great Smoky Mountains. I. Diatrype Fr. (Ditrypacées)
Dix espèces de Diatrype sont signalées dans le parc national des Great Smoky Mountains, dans l'est des États-Unis. Neuf d'entre eux sont de nouveaux signalements pour le parc et deux (D. atlantica et D. montana) sont décrits comme de nouvelles espèces. Des descriptions et une clé de toutes les espèces de Diatrype maintenant connues du Parc sont fournies. (Voir PDF)

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Une redescription de Marasmius pellucidus, une espèce répandue en Asie du Sud
Marasmius pellucidus est redécrit à partir d'analyses de spécimens types et de matériel récemment collecté en Asie du Sud. Il est illustré et comparé à de nombreux taxons alliés d'Afrique et d'Amérique du Sud. Marasmius papyraceus et Cantharellus elegans sont acceptés comme synonymes. (Voir PDF)

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Phylogénie moléculaire des espèces d'Amanites d'Asie orientale (Agaricales, Basidiomycota) : implications taxonomiques et biogéographiques
Les relations phylogénétiques, la taxonomie et la biogéographie du genre Amanita en mettant l'accent sur les espèces d'Asie orientale ont été estimées à l'aide de données de séquence provenant à la fois des régions d'espacement transcrit interne (ITS) et de la grande sous-unité (nLSU) de l'ADN ribosomique nucléaire. La séparation des deux sous-genres traditionnellement acceptés n'était pas bien étayée. Chaque section d'Amanita, Vaginatae, Caesareae, Phalloideae, Validae et Amidella était considérée comme monophylétique par différentes méthodes d'analyse et ensembles de données de différentes régions. La monophylie de la section Lepidella est restée incertaine. Quelques implications biogéographiques et taxonomiques ont été déduites : (1) quelques espèces d'Amanita sont largement réparties dans toute l'Asie orientale, l'Europe et l'Amérique du Nord. Les échantillons de certaines espèces disjointes précédemment reconnues dans l'hémisphère nord n'étaient pas monophylétiques. Ainsi, les distributions disjointes intercontinentales putatives de ces espèces n'ont pas été étayées dans cette étude (2) les relations biogéographiques entre Amanita d'Asie orientale et d'Europe sont relativement proches et plusieurs taxons sont communs aux deux régions, tandis que des espèces appariées ou étroitement apparentées entre l'Asie orientale et L'Amérique du Nord est relativement commune, mais a rarement été confirmée comme des populations disjointes de la même espèce par les données moléculaires. Un certain nombre d'espèces d'Amanita en Amérique du Nord étiquetées avec des noms basés sur des matériaux européens doivent être considérées comme des espèces distinctes (3) quelques espèces génétiquement cryptiques d'Amanita dans le sud-ouest de la Chine doivent être délimitées et (4) des variations de couleur et de morphologie de la les fructifications d'A. parvipantherina provenant de différentes localités doivent être interprétées comme des modifications de l'environnement. (Voir PDF)

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Cordyceps camposterna, un nouveau pathogène de Campsosternus auratus
Une nouvelle espèce, Cordyceps camposterna, infectant les adultes et les nymphes de Campsosternus auratus qui a été collectée dans la réserve naturelle de Gutian dans le comté de Huidong, dans la province du Guangdong, en Chine, est décrite et illustrée. L'espèce se distingue des autres espèces du sous-genre Eucordyceps par ses stromates jaune verdâtre avec de longs rhizoïdes, des périthèces immergés verticalement et des ascospores filiformes avec plusieurs septa, se brisant en fragments de 2,9 à 5,9 &fois 1 µm. (Voir PDF)

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Champignons de nid d'oiseau de Chine
Cyathus lijiangensis et C. renweii sont des espèces nouvelles pour la science signalées dans cet article. Crucibulum parvulum, Cyathus crassimurus, C. julietae et C. triplex sont signalés pour la première fois en Chine. Les nouvelles espèces sont illustrées et comparées à des espèces similaires. (Voir PDF)


Ascoyunnania aquatica gen. et sp. nov., un champignon d'eau douce récolté en Chine et sa conidiation microcyclique
Ascoyunnania aquatica gen. et sp. nov. est introduit pour accueillir une espèce d'ascomycète remarquable collectée à partir de bambou submergé dans un petit ruisseau à Jinghong, Xishuangbanna, Yunnan, Chine. Ce champignon se caractérise par des ascomes ostiolés profondément immergés, des asques unitunicates, cylindriques à clavées, dépourvus d'appareil apical, et des ascospores ellipsoïdales, unicellulaires, hyalines, guttuées qui germent pour former des spores secondaires brun foncé à noires, globuleuses et tuberculées. Cette espèce et sa conidiation microcyclique sont illustrées et décrites dans cet article. Le rôle écologique de la conidiation microcyclique et l'affinité taxonomique d'A. aquatica sont discutés.

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Un nouvel agaric bioluminescent de São Paulo, Brésil
Une nouvelle espèce, Gerronema viridilucens, prélevée sur l'écorce d'arbres Eugenia fluminensis vivants dans la région de la forêt atlantique de São Paulo, au Brésil, est décrite, illustrée et comparée à des taxons phénétiquement similaires. Il représente la seule espèce connue de Gerronema avec des propriétés bioluminescentes et peut représenter une évolution indépendante de ce trait parmi les euagarics. (Voir PDF)

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De nouvelles espèces de Chaetosphaeria, Melanopsammella et Tainosphaeria gen. nov. des Amériques
Dix nouvelles espèces de Chaetosphaeria et une nouvelle espèce de Melanopsammella sont décrites en Amérique du Nord tempérée et tropicale. Le nouveau genre Tainosphaeria est également décrit et Chaetosphaeria capitata est signalé pour la première fois dans les Néotropiques. Sept anamorphes différents et distinctifs sont signalés et connectés aux téléomorphes de Chaetosphaeria. La diversité morphologique des anamorphes de Chaetosphaeria et sa signification phylogénétique sont discutées. (Voir PDF)

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Preuve de compétition in situ entre les champignons en eau douce
Cinq espèces de champignons, isolées de bois submergé collecté dans une forêt marécageuse de tourbe du Brunei, ont été testées pour leur capacité compétitive. Annulatascus velatisporus, Beverwykella pulmonaria, Dactylella sp., Monodictys pelagica et Pleurophragmium sp. ont été appariées dans toutes les combinaisons possibles sur bois et gélose en laboratoire. De plus, des blocs de bois autoclavés ont été inoculés avec ces isolats et replacés dans l'eau dans la forêt marécageuse de tourbe. Sur gélose, il y avait une hiérarchie compétitive de Dactylella sp. > Pleurophragmium sp. > A. velatisporus > B. pulmonaria > M. pelagica. Cependant, dans les blocs inoculés exposés dans la forêt marécageuse de tourbe, M. pelagica, A. velatisporus et B. pulmonaria étaient les seules espèces à réduire de manière significative la colonisation d'autres champignons, montrant une forte disparité entre les résultats de terrain et de laboratoire. Des études de laboratoire sur le bois ont révélé qu'A. velatisporus réduisait la capacité de reproduction d'autres champignons. Cette étude démontre l'influence de la compétition interspécifique dans la colonisation fongique du bois immergé. (Voir PDF)

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Diversité des polypores du bois dans la forêt tempérée avec différents types de végétation au Japon
La composition des espèces et la diversité des polypores du bois ont été examinées dans des forêts de hêtres, de Castanopsis, de chênes secondaires, de pins secondaires, de cèdres du Japon et de cyprès Hinoki situés dans une région tempérée du Japon. L'analyse groupée des communautés de polypores a révélé une corrélation entre les types de végétation forestière et la composition en espèces des polypores présents dans les forêts. La diversité des polypores est élevée dans les forêts de hêtres par rapport aux forêts secondaires et aux plantations de conifères. Il existe plusieurs espèces spécifiques aux forêts de hêtres, de Castanopsis et de pins secondaires, respectivement. On s'attend à ce que les forêts de chênes secondaires servent de refuge et de corridors pour de nombreuses espèces vivant dans les forêts de feuillus. (Voir PDF)

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Podosphaera salatai sp. nov. (Erysiphales) de Géorgie
Podosphaera salatai sp. nov., une nouvelle espèce d'oïdium sur Cerasus incana (Rosaceae) en Géorgie (Transcaucasie), est décrite, illustrée, comparée à des espèces apparentées et discutée. (Voir PDF)

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Ajouts aux Erysiphaceae brésiliennes : Ovulariopsis durantae sp. nov. et Streptopodium tabebuiae sp. nov.
Deux nouvelles espèces d'oïdium anamorphique du Brésil sont décrites : Ovulariopsis durantae sur Duranta erecta (Verbenaceae) et Streptopodium tabebuiae sur Tabebuia serratifolia (Bignoniacaeae). Ovulariopsis durantae est comparé et distingué d'autres anamorphes de Phyllactinia avec des cellules de pied de conidiophore sinueuses à tordues en spirale. Les motifs de surface de la paroi externe de ses conidies sont différents de ceux présentés comme typiques de la sous-famille Phyllactinioideae. Streptopodium tabebuiae peut être facilement distingué des cinq espèces de Pleochaeta connues pour avoir des anamorphes de Streptopodium et aussi des deux espèces strictement anamorphiques de Streptopodium par la combinaison de deux caractéristiques : de très longs conidiophores et des cellules de pied de conidiophore droites. (Voir PDF)

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Arthrobotrys yunnanensis sp. nov., le quatrième anamorphe d'Orbilia auricolor
Une nouvelle espèce de champignons prédateurs, Arthrobotrys yunnanensis, est décrite et illustrée comme le quatrième anamorphe d'Orbilia auricolor. Le champignon produit des conidiophores simples et dressés avec plusieurs denticules apicaux courts. Les conidies sont non septées ou parfois uniseptées, allongées ellipsoïdes-cylindriques ou légèrement clavées. Dans les cultures âgées, il forme des chlamydospores sphériques à ellipsoïdales. En présence de nématodes, le champignon forme des réseaux adhésifs tridimensionnels. Dans cet article, les anamorphes connus liés au genre Orbilia sont également résumés. (Voir PDF)

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Caractérisation morphologique et moléculaire des espèces de Colletotrichum à partir de plantes herbacées en Thaïlande
Trente-quatre isolats de Colletotrichum spp. ont été isolés de banane, gingembre, Euphatorium thymifolia, soja, longane, mangue et Draceana sanderiana. Ils comprenaient des endophytes provenant de plantes saines et des agents pathogènes probables provenant de lésions pathologiques. Les isolats ont été identifiés et regroupés en fonction de la morphologie de la colonie, ainsi que de la taille et de la forme des appressoriums et des conidies. L'analyse moléculaire basée sur les séquences des espaceurs transcrits internes de l'ADNr (ITS1 et ITS2) a indiqué que les isolats de Colletotrichum comprenaient quatre clades parallèles aux groupements morphologiques. La plupart des isolats se sont regroupés au sein de trois clades distincts qui représentaient potentiellement des espèces différentes. Les endophytes isolés de différents hôtes sont plus susceptibles d'être de la même espèce. Colletotrichum musae était positionné à proximité des clades de C. gloeosporioides. L'analyse morphologique et phylogénétique des agents pathogènes et des endophytes de Colletotrichum a montré que les isolats endophytes étaient les plus similaires à C. gloeosporioides, mais aucun isolat pathogène n'a été regroupé avec des isolats endophytes. La corrélation entre le regroupement morphologique et moléculaire a démontré les relations génétiques entre les isolats et les espèces de Colletotrichum et a indiqué que les données de séquence d'ADNr ITS étaient potentiellement utiles dans la détermination des espèces taxonomiques. (Voir PDF)

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Viabilité et biodiversité des hyphomycètes d'eau douce dans la mousse à Ton Nga Chang Wildlife-Sanctuary, Songkhla, sud de la Thaïlande
Une enquête sur les hyphomycètes d'eau douce a été menée à Ton Nga Chang Wildlife-Sanctuary, Songkhla, Thaïlande. La viabilité des hyphomycètes aquatiques piégés dans de la mousse fraîche et ancienne a été estimée à l'aide d'une coloration au bromure de tétrazolium (MTT). Les pourcentages de conidies avec au moins une cellule viable étaient de l'ordre de 44 à 77 % et de 42 à 69 % dans la mousse fraîche et ancienne, respectivement. La viabilité des conidies dans la mousse fraîche et ancienne n'était pas significativement différente à (P>0,05). Anguillospora sp., Helicomyces sp., Thozetella sp. et Volutella sp. ont été testés pour leur viabilité dans des conditions de laboratoire. La viabilité des conidies après aération dans l'eau est restée à 83-88%, après sept jours. Cependant, seulement 3 à 45 % sont restés viables après séchage pendant 10 heures. Soixante-deux champignons ont été recensés au cours de cette étude, dont 48 espèces dans 34 genres et 14 taxons non identifiés. (Voir PDF)

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Cordana versicolor sp. nov. (hyphomycète dématié) causant des taches foliaires sur Canna denudata (Cannacées) au Brésil, avec des observations sur Cordana musae
Cordana versicolor, un nouveau champignon anamorphique dématié, a été trouvé au Brésil associé à des taches foliaires sur l'herbacée ornementale Canna denudata. Il diffère morphologiquement des espèces apparentées et est la première espèce du genre qui s'est avérée pathogène pour un membre des Cannacées. Il produit des appressoria en forme de gant de boxe apicalement sur les tubes germinatifs. Une espèce apparentée, C. musae pathogène sur bananier, produit des appressoria ampulliformes. L'importance taxonomique de ces structures distinctes n'a pas été envisagée auparavant pour ce genre. (Voir PDF)

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Caractères sporaux dans Gomphales et leur importance pour la phylogénétique
Traditionnellement, les caractères sporaux, tels que la couleur, la forme et l'ornementation, ont joué un rôle important dans la différenciation des différents genres au sein des Gomphales. Dans certains cas, cependant, aucune analyse précise n'a été faite qui nous permettrait de construire des homologies primaires entre ces caractéristiques et d'autres spores. Pour cette étude, les caractéristiques des basidiospores de 14 taxons de Gomphales ont été examinées, en utilisant à la fois la microscopie photonique et électronique. Ces examens ont clairement démontré que l'ornementation des spores est un caractère très variable et des données, telles que la forme de la base de la spore et de l'appendice hilaire, auparavant non prises en compte dans la taxonomie de ce groupe, peuvent être très informatives à ce niveau. (Voir PDF)

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Les champignons du charbon (Ustilaginomycètes) de Chrysopogon (Poaceae)
La description des dix espèces reconnues de champignons du charbon de Chrysopogon est donnée. Une liste hôte-parasite et une clé facilitent l'identification de ces espèces. Une nouvelle espèce est proposée : Sporisorium tumiforme Vánky & R.G. Shivas (type sur Chrysopogon pallidus, Australie). Deux nouvelles combinaisons sont : Sporisorium azmatii (Mundk.) Vánky (basé sur Sorosporium azmatii, type sur Chrysopogon coeruleus, Inde) et Sporisorium chrysopogonis-grylli (Thirum. & Pavgi) V-aacutenky (basé sur Chrygrryopogso , Inde). Un lectotype est désigné pour Sorosporium tumefaciens McAlpine (= Sporisorium tumefaciens). (Voir PDF)

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Effets des champignons mycorhiziens arbusculaires sur un arbre enrichissant la jachère (Macaranga denticulata)
Macaranga denticulata est une espèce d'enrichissement de la jachère qui est importante dans l'agriculture des hautes terres dans certaines parties du nord de la Thaïlande. La zone racinaire de cet arbre supporte une grande biodiversité de champignons mycorhiziens arbusculaires (MA) et il a été postulé que ceux-ci sont importants pour que le Macaranga s'établisse rapidement dans les champs perturbés. Pour évaluer cela, des semis ont été inoculés avec des spores de champignons MA (Glomus spp., G. fasciculatum, Acaulospora spp. et espèces mixtes de champignons MA) recueillies sur le terrain, puis cultivées sans engrais phosphaté. La croissance de l'hôte a été comparée à celle de plantes cultivées simultanément à six taux d'application de phosphore (0 à 150 mg P/kg de sol). Les expériences ont été menées dans des pots contenant 5 kg de terre stérilisée. L'inoculation mycorhizienne arbusculaire a augmenté la hauteur et le poids sec de la plante. Les poids secs de M. denticulata inoculés avec Acaulospora spp. ou des espèces mixtes de champignons MA étaient équivalentes à des plantes non inoculées ayant reçu 150 mg de P/kg de sol, tandis que les plantes inoculées avec Glomus spp et G. fasciculatum étaient similaires à celles avec 25 mg de P/kg de sol. Contenu nutritionnel de la plante inoculée avec Acaulospora spp. et les espèces mixtes de champignons MA étaient plus élevées que les plantes inoculées avec Glomus spp et G. fasciculatum. La colonisation racinaire des plantes inoculées avec Acaulospora spp. et les espèces mixtes de champignons MA n'étaient pas significativement différentes et étaient plus élevées que les autres traitements inoculés. Ces expériences ont montré que M. denticulata dépend des champignons MA pour une croissance rapide dans un sol pauvre en P. Acaulospora morrowiae semble être l'espèce dominante sporulant dans les zones racinaires des plantes inoculées avec Acaulospora spp. ou des espèces mixtes de champignons AM. Des travaux supplémentaires sont nécessaires pour identifier les espèces AM les plus efficaces pour M. denticulata puisque l'abondance des spores AM dans la zone racinaire peut ne pas être directement liée à l'efficacité de la colonisation des racines dans l'absorption des nutriments de l'arbre. (Voir PDF)

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Une revue de Cirrenalia (hyphomycètes) et une nouvelle espèce
Un nouvel hyphomycète hélicosporé, Cirrenalia longipes, collecté sur du bois mort dans le Yunnan, en Chine, est décrit et illustré. La nouvelle espèce se caractérise par des conidies brun foncé à noires avec de longs filaments basaux multi-septés, qui se séparent généralement du corps conidien. Les différences avec les autres espèces de Cirrenalia sont discutées. Trois espèces de Cirrenalia, C. donnae, C. macrocephala et C. nigrospora sont nouvelles en Chine. Les caractéristiques de 16 espèces de Cirrenalia sont présentées sous forme de tableau. (Voir PDF)

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Redisposition des spécimens déposés sous Lachnea dans le HMAS
Les collections de Lachnea déposées au HMAS ont été réexaminées. Quatorze taxons appartenant à 6 genres ont été trouvés. Parmi eux, Melastiza daliensis, Scutellinia adamdiopsis, S. beijingensis et S. kerguelensis var. microspora sont décrits comme de nouveaux taxons. Scutellinia ahmadii est signalé pour la première fois en Chine. (Voir PDF)


Évaluation phylogénétique et révision taxonomique de Schizothecium basée sur l'ADN ribosomique et les gènes codant pour les protéines.
La taxonomie de Schizothecium et Podospora a fait l'objet de débats. Ces deux genres ont déjà été traités comme congénères en raison de l'absence de caractères morphologiques distinctifs. Cette étude se concentre principalement sur les relations phylogénétiques de Schizothecium et Podospora, ainsi qu'une réévaluation de la signification taxonomique des caractères morphologiques. Plusieurs séquences de gènes (ADNr 28S partiel, ADNr ITS/5.8S et ß-tubuline partielle) ont été analysées en utilisant une parcimonie maximale et des analyses bayésiennes. Dans toutes les analyses, espèce de Schizothecium caractérisée par des périthèces ornés de poils agglutinés renflés ou de cellules péridiales saillantes proéminentes, regroupés en un clade monophylétique fortement soutenu. Schizothecium devrait donc recevoir le statut générique approprié et ne pas être traité comme un congénère de Podospora. Les analyses phylogénétiques fournissent un bon support indiquant que les morphologies ascomateuses sont plus informatives sur le plan phylogénétique que les caractères des ascospores et l'association hôte ou habitat. Un résumé et une clé des espèces de Schizothecium maintenant reconnues dans le genre sont donnés. Podospora s'est avéré être un genre polyphylétique, composé d'un groupe d'espèces morphologiquement hétérogènes et phylogénétiquement distantes. Les données préliminaires indiquent qu'une révision complète de Podospora et des genres apparentés est nécessaire.

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Connexions téléomorphes-anamorphes : Chaetosphaeria raciborskii et espèces apparentées, et leurs anamorphes de type Craspedodidymum
Plusieurs espèces de Chaetosphaeria ont été reconnues comme ayant une structure de paroi ascomale distinctive et des ascospores scolecosporous. Des spécimens correspondant à cette description ont été trouvés à plusieurs reprises dans de nombreuses localités de collecte dans les zones tempérées et tropicales et tandis que l'affectation au groupe global était facile sur la base des cellules de la paroi ascomale uniques, il était plus difficile de déterminer le nombre réel d'espèces. Les taxons représentant la diversité de ce groupe ont été ciblés pour une analyse phylogénétique en utilisant la région d'espacement transcrite interne de la grande sous-unité nrDNA (ITS). Sur la base des données moléculaires, deux clades monophylétiques ont été trouvés qui correspondent à la circonscription de deux espèces existantes, C. lapaziana et une nouvelle combinaison, C. ellisii. Deux nouvelles espèces sont reconnues, une basée sur une morphologie téléomorphe distinctive et une basée sur des données de culture. Chaetosphaeria raciborskii est considéré comme polyphylétique et le nom est utilisé pour des spécimens tropicaux avec des ascomes de petite taille et longuement soyeux. Toutes les espèces ont des anamorphes de type Craspedodidymum en culture et deux espèces ont en plus un synanamorphe de type Chloridium. Toutes les espèces sont décrites et illustrées. (Voir PDF)

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Caractérisation morphologique et moléculaire des mycéliums de champignons ectomycorhiziens en culture pure
Boletus edulis, Boletus aestivalis, Boletus luridus, Amanita muscaria et Hebeloma radicosum mycelia ont été isolés en culture pure et caractérisés par des méthodes morphologiques et moléculaires. L'identification moléculaire a été réalisée par des analyses de séquences de la région ITS des gènes de l'ARN ribosomique nucléaire. L'affiliation phylogénétique des mycéliums isolés a été évaluée par comparaison de leurs séquences ITS avec celles déposées dans la base de données GenBank. Des cultures pures d'isolats des différents genres fongiques à l'étude ont montré des différences dans le taux de croissance, la morphologie des colonies et/ou les caractères biométriques des hyphes. En revanche, les caractéristiques morphologiques des mycéliums des trois espèces de Boletus étaient similaires, mais ces espèces se distinguaient par les données ITS. Des problèmes subsistent cependant dans l'affiliation de ces séquences ITS avec celles du groupe B. edulis qui sont actuellement déposées dans des bases de données publiques. (Voir PDF)

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Biodiversité des microchampignons saprobiques associés aux infrutescences des espèces Protea en Afrique du Sud
La biodiversité des microchampignons saprobiques présents dans les infrutescences de Protea (capitules) a été étudiée. Un total de 28 espèces fongiques dont 14 ascomycètes et 14 champignons anamorphiques ont été collectés entre 2000-2001. La mycoflore des infrutescences, en particulier des fleurs, s'est avérée totalement différente de celle des bractées et des autres tissus de Protea. Cela indique leur caractère unique en tant que micro-habitat fongique. De plus, la majorité des espèces d'ascomycètes isolées de ces fleurs étaient caractérisées par de longs cols ostiolaires. Cette découverte indique que les insectes jouent un rôle majeur dans la dispersion des ascomycètes qui se produisent sur ces infrutescences, ce qui est encore corroboré par le nombre inhabituellement élevé d'insectes qui fréquentent ces fleurs. A partir de ces données, il est clair que la flore fongique saprobique des infrutescences de Protea a un rôle écologique unique. Cependant, la nature exacte de cette interaction ne deviendra claire qu'une fois que d'autres études seront menées pour surveiller les composants individuels de cet écosystème. (Voir PDF)

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Détermination de la diversité fongique sur Dendroctonus ponderosae et Ips pini affectant le pin tordu à l'aide de méthodes culturales et moléculaires
Plusieurs coléoptères (Coleoptera : Scolytidae) et leurs associés fongiques causent de graves dommages au pin tordu dans l'ouest du Canada et le nord-ouest des États-Unis. La diversité fongique de la surface de deux espèces de scolytes, Dendroctonus ponderosae Hopkins (dendroctone du pin ponderosa) et Ips pini Say (graveur de pin), a été étudiée à l'aide de méthodes culturales et moléculaires. Neuf taxons fongiques ont été reconnus par des caractérisations morphologiques. Les neuf taxons ont été isolés du dendroctone du pin ponderosa alors que seulement sept des neuf taxons ont été isolés du graveur du pin. L'identification était basée sur la morphologie culturelle et les similitudes de séquences élevées de la région de l'espaceur transcrit interne (ITS) et de la grande sous-unité d'ADN ribosomique (LSU rDNA) avec des séquences de champignons connus. Les régions ITS fongiques ont été amplifiées à partir d'ADN directement extrait de la surface du coléoptère. Les produits de PCR ont été clonés et 250 clones ont été classés par leur schéma de restriction avec HaeIII et Rsal. Au total, 26 types RFLP ont été identifiés puis séquencés. Parmi eux, 15 types RFLP ont été identifiés comme étant présents chez le dendroctone du pin ponderosa et 14 étaient présents chez le pin graveur. L'analyse des séquences des types RFLP a montré que 23 ascomycètes et 3 basidiomycètes étaient représentés dans les bibliothèques de clones, tandis que les isolats de la méthode de culture représentaient 7 ascomycètes et 2 basidiomycètes. Nous avons constaté que la levure et les champignons euascomycètes filamenteux non colorants étaient détectés efficacement à l'aide d'une approche moléculaire, tandis que les principaux champignons colorant la sève et les champignons de décomposition étaient mieux détectés à l'aide de méthodes de culture (Voir PDF)

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Enquête préliminaire sur les Bionectriacées et les Nectriaceae (Hypocreales, Ascomycètes) de Jigongshan, Chine
Des espèces de Bionectriacées et de Nectriaceae sont signalées pour la première fois à Jigongshan, dans la province du Henan, dans le centre de la Chine. Parmi elles, trois nouvelles espèces, Cosmospora henanensis, Hydropisphaera jigongshanica et Lanatonectria oblongispora, sont décrites. Trois espèces d'Albonectria et de Cosmospora sont signalées pour la première fois en Chine. (Voir PDF)

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Diversité des hyphomycètes aquatiques dans les cours d'eau du nord-ouest du Portugal
Ce travail examine la distribution des hyphomycètes aquatiques dans les cours d'eau du nord-ouest du Portugal avec différentes conditions environnementales. Cinq sites se trouvent dans le bassin de la rivière Ave dans une zone à forte densité de population, avec une agriculture intensive et des activités industrielles. Trois autres sites se trouvent dans le bassin de la rivière Cávado et appartiennent au parc national Peneda-Gerês. Malgré cette enquête a été menée dans une petite zone et pendant une courte période de temps, une grande diversité d'espèces d'hyphomycètes aquatiques a été trouvée. Un total de 113 taxons fongiques ont été identifiés au moins au niveau générique, dont ca. 90% ont été classés comme hyphomycètes aquatiques au sens traditionnel du terme. Plusieurs espèces rares d'hyphomycètes aquatiques ont été trouvées, dont cinq sont signalées ici pour la première fois dans la péninsule ibérique et sept sont de nouveaux signalements au Portugal. La plus grande richesse en espèces a été trouvée à la source du bassin de la rivière Este - rivière Ave (77 taxons) et dans les ruisseaux du parc national (40-58 taxons). Une diminution de la richesse des espèces d'hyphomycètes aquatiques a été constatée sur les sites pollués du bassin de la rivière Ave (23-29 taxons). La distribution des espèces d'hyphomycètes aquatiques par analyse de cluster et ordination CA oppose les sites pollués et non pollués, suggérant que la chimie de l'eau était le principal facteur régulant la structure des communautés d'hyphomycètes aquatiques. (Voir PDF)

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De nouvelles amorces pour la détection de Smittium spp. (Trichomycètes, Zygomycota) chez les insectes hôtes
Les thalles distinctifs des trichomycètes ne peuvent être isolés qu'à partir du stade larvaire de l'hôte. Il y a un manque général de connaissances sur la présence de trichomycètes à d'autres stades de développement de leur hôte. Deux nouvelles amorces, TR3F et TR4R, ont été conçues sur la base de séquences d'ADN ribosomique SSU de deux espèces Harpella, une espèce Harpellomyces, quatre espèces Smittium et Aedes aegypti (hôte). Ces amorces amplifiaient l'ADN d'espèces des Harpellales mais discriminaient d'autres groupes d'organismes, y compris d'autres embranchements fongiques. La présence d'espèces Smittium a été détectée dans des pupes et des mouches adultes d'Aedes aegypti infectées en laboratoire et dans des larves de Culex pipiens collectées sur le terrain par PCR en utilisant les nouvelles amorces. (Voir PDF)

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Un ajout au genre d'hyphomycètes Melanographium de Thaïlande
Le genre Melanographium est passé en revue, une clé des espèces acceptées est fournie et sa répartition géographique est discutée. Melanographium proliferum collecté sur des feuilles mortes d'un grimpeur en Thaïlande est illustré, décrit comme une nouvelle espèce et comparé à d'autres espèces de Melanographium. (Voir PDF)

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Trematosphaeria : concepts taxonomiques, nouvelles espèces du Japon et clé des espèces
Deux nouvelles espèces, Trematosphaeria crassiseptata prélevées sur des rameaux morts d'une plante inconnue près d'une rivière, et T. biappendiculata prélevés sur des rameaux immergés dans des étangs, sont décrites et illustrées. Trematosphaeria crassiseptata se caractérise par des ascospores à parois épaisses, brun rougeâtre et 5 septées, tandis que T. biappendiculata se distingue par ses ascospores à appendices terminaux. Dans les milieux de culture, T. crassiseptata a produit l'état téléomorphe et T. biappendiculata n'a produit qu'un état microconidien de type Pleurophomopsis. Les différences entre ces nouvelles espèces et leurs taxons apparentés sont notées. Une clé des 15 espèces acceptées dans le genre est donnée. (Voir PDF)

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Écologie et succession fongiques sur Phragmites australis dans un marais saumâtre. I. Gaines foliaires
L'observation directe de la succession fongique et du développement communautaire sur les gaines foliaires de Phragmites australis a été étudiée sur une période de 19 mois dans un marais saumâtre de l'Escaut (Pays-Bas). Soixante-dix-sept taxons ont été identifiés : 33 ascomycètes (43 %) 31 coelomycètes (40 %) 9 hyphomycètes (12 %) et 4 basidiomycètes (5 %). Quatre microhabitats ont été criblés, les communautés du haut, du milieu et de la base le long de l'axe vertical des pousses de roseau sur pied et une communauté dans la couche de litière. La structure de la communauté fongique analysée par analyse multivariée a montré que tous les microhabitats sont caractérisés par différents mycota. L'analyse des correspondances sans tendance (ACD) des échantillons de gaine foliaire suggère l'importance d'une séparation spatiale (microhabitat) pour expliquer la variation des espèces entre les échantillons. Dans chacun de ces microhabitats, le DCA a indiqué un modèle temporel spécifique (succession). La succession fongique (développement communautaire) a été décrite par une séquence de trois phases dans la sporulation fongique. Pour les différents microhabitats et tous les stades de succession, des espèces indicatrices ont été attribuées. L'importance du criblage des plantes hôtes in situ et l'utilisation de l'analyse des espèces indicatrices pour les communautés fongiques sont abordées. L'effet de la saisonnalité sur la succession fongique est discuté. (Voir PDF)

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Pyrénomycètes du parc national des Great Smoky Mountains. II. Cryptovalsa Ces. et De Non. et Diatrypella (Ces. et De Not.) Nitschke (Diatrypaceae)
Des descriptions et des clés sont fournies pour les cinq espèces de Cryptovalsa et huit espèces de Diatrypella maintenant connues du parc national des Great Smoky Mountains dans l'est des États-Unis. Dix d'entre eux sont de nouveaux records pour le Parc. Cryptovalsa mori (Nitschke) Lar. Peigne N. Vassiljeva. nov., Cryptovalsa opaca (Cooke) Lar. Peigne N. Vassiljeva. nov., et Diatrypella major (Berl.) Lar. Peigne N. Vassiljeva. nov. sont proposées comme de nouvelles combinaisons pour les taxons respectifs. (Voir PDF)

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Notes sur les hyphomycètes dictyosporeux de Chine VII. Le genre Nimbya
Deux nouvelles espèces, Nimbya dianthi et N. dolichi sont décrites. Ils diffèrent des espèces de Nimbya précédemment signalées par la morphologie des conidies et la gamme d'hôtes. Cinq autres espèces sont enregistrées en Chine et le genre est examiné sur la base de la littérature. Les caractères diagnostiques de 17 espèces acceptées de Nimbya sont tabulés et une clé de toutes les espèces connues est fournie. (Voir PDF)

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Un facteur de virulence potentiel impliqué dans la pathogénicité fongique : activité protéase de type sérine du champignon nématophage Clonostachys rosea
Une protéase de type sérine (appelée Lmz1) a été purifiée jusqu'à homogénéité à partir de Clonostachys rosea. Il a montré une masse moléculaire d'environ 33 kDa, pI 10,5, une activité optimale de Lmz1 à 60°C et pH 11-12, et une large stabilité du pH entre pH 5-12. Lmz1 a une valeur Km pour Suc-(Ala)2-Pro-Phe-pNA de 1,45 mM. L'activité protéase était complètement inhibée par le PMSF ou l'inhibiteur de subtilisine streptomyces, et partiellement inhibée par l'inhibiteur de la collagénase I, tout indiquait la présence d'un résidu sérine dans le site actif et Lmz1 est donc très probablement un membre de la famille des sérine protéases. Sa séquence d'acides aminés N-terminale a été directement séquencée par dégradation d'Edman. Le plasmide recombinant hébergeant un gène d'ADNc codant pour la protéase mature a été intégré dans l'ADN chromosomique de levure et le gène a été exprimé avec succès comme démontré par analyse d'activité, ELISA et Western blot. L'activité nématotoxique de la protéase impliquée dans l'infection fongique a été caractérisée par l'immobilisation des nématodes et la dégradation de la cuticule avec la protéase Lmz1 purifiée ou recombinante, et vérifiée en outre par immunodéplétion à l'aide d'un antisérum anti-Lmz1 préparé chez la souris. Ces observations suggèrent un modèle de recherche pour le mécanisme d'infection fongique de l'implication de la protéase de type sérine. (Voir PDF)